台风放假通常不应扣全勤奖。以下从不同角度为您详细分析：

法律法规角度

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，因自然灾害等不可抗力因素导致的工作中断，并不属于劳动者个人原因造成的缺勤。全勤奖的设立，通常是为了奖励那些在正常工作时间内无缺勤记录的员工。在台风等自然灾害导致放假的情况下，员工并非出于个人意愿而缺勤，而是由于不可抗力因素。因此，从法律法规的角度来看，因台风放假不应成为扣发全勤奖的理由。

公司规章制度角度

1. 规章制度合法性：公司规章制度应当符合国家法律法规的规定。如果公司规章制度中明确规定因台风等自然灾害放假将扣发全勤奖，那么该规定可能因违反法律法规而无效。
2. 规章制度合理性：即使公司规章制度中有相关规定，也需要考虑其合理性。全勤奖的设立旨在激励员工，而因不可抗力因素导致的缺勤并非员工所能控制。因此，将此类缺勤纳入全勤奖的扣发范围，可能缺乏合理性。

实际操作角度

1. 员工权益保护：在实际操作中，公司应当充分考虑员工的权益。因台风等自然灾害放假，员工已经承受了生活上的不便，如果再因此扣发全勤奖，无疑会加重员工的负担。
2. 公司形象与员工关系：公司对待此类事件的态度，也会影响其形象和员工关系。一个能够体谅员工、合理处理此类事件的公司，往往能够赢得员工的信任和忠诚。

建议与措施

1. 与公司沟通：如果您认为因台风放假扣发全勤奖不合理，可以与公司进行沟通，表达您的观点和诉求。
2. 了解公司政策：在入职或签订劳动合同时，了解公司关于全勤奖的政策和规定，以便在发生争议时能够维护自己的权益。
3. 寻求法律援助：如果公司坚持扣发全勤奖，且您认为该行为违反了法律法规或公司规章制度，可以寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。

总结来看，因台风放假通常不应扣全勤奖。这既符合法律法规的规定，也体现了公司对员工权益的尊重和保护。如果您在此类问题上遇到争议或困惑，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。