核心结论：员工工伤后自动离职，公司若想与员工签订协议，需确保协议内容合法、明确双方权利义务，特别是关于工伤赔偿、离职补偿等事项。不建议直接使用通用范文，而应根据具体情况定制协议。以下从协议内容要点、法律风险防范、协议示例框架三个方面进行说明。

1. 协议内容要点

• 工伤事实确认：协议中应明确员工受伤的时间、地点、原因及工伤认定情况（如已认定工伤，需注明认定书编号；如未认定，可约定后续认定责任）。
• 赔偿项目与金额：列明公司应支付的工伤赔偿项目（如一次性伤残补助金、医疗费、停工留薪期工资等）及具体金额，确保符合《工伤保险条例》及地方规定。
• 离职补偿：若员工因工伤离职，需明确离职补偿标准（如经济补偿金、代通知金等），避免与工伤赔偿混淆。
• 双方权利义务：约定员工放弃后续追偿权利（如有）、公司履行赔偿义务的时间及方式，以及违约责任。
• 协议效力：明确协议生效条件（如双方签字盖章后生效）、争议解决方式（如仲裁或诉讼）。

2. 法律风险防范

• 避免显失公平：协议内容不得免除公司法定责任（如未足额支付工伤赔偿），否则可能被认定为无效条款。
• 员工自愿性：需确保员工签署协议时无胁迫、欺诈情形，建议留存签署过程的视频或书面确认。
• 合规性审查：协议条款需符合《劳动合同法》《工伤保险条例》等法律法规，避免因违法条款导致协议无效。

3. 协议示例框架（非通用范文）

标题：工伤离职补偿协议
甲方（公司）：名称、地址、法定代表人
乙方（员工）：姓名、身份证号、联系方式
鉴于：

1. 乙方于__年月日在工作中受伤，经认定为工伤（认定书编号：____）；
   
2. 双方协商一致，乙方自愿离职，甲方同意支付工伤赔偿及离职补偿。
   协议内容：
   
3. 工伤赔偿：甲方支付乙方一次性伤残补助金元、医疗费元、停工留薪期工资元，合计元，于__年月__日前支付。
   
4. 离职补偿：甲方支付乙方经济补偿金元，于年月__日前支付。
   
5. 权利放弃：乙方确认收到上述款项后，不再就本次工伤向甲方主张任何权利。
   
6. 违约责任：若甲方未按时支付，需按未付金额的__%支付违约金。
   
7. 争议解决：本协议履行中发生争议，双方协商解决；协商不成，提交甲方所在地劳动仲裁委员会仲裁。
   甲方（盖章）：__________ 乙方（签字）：__________
   日期：__年月__日
   

提示：协议需根据实际情况调整，建议签署前由法律专业人士审核。若有具体问题，可直接向我咨询。