旷工三日自动离职是否合法，需视具体情况及单位规章制度而定，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：

一、若公司规章制度有明确规定且合法公布

若公司内部的规章制度已经明确规定了旷工三日即等同于自动离职的条款，并且这一规章制度已经通过合法的途径制定（如经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定），且向全体员工进行了公布，那么在此种情境之下，旷工三日自动离职的做法或许可以被认为是合法的企业行为。

法律依据：

• 《中华人民共和国劳动合同法》第四条规定，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。

二、若公司规章制度无明确规定

如果公司未能提供这样明确且具有法律效力的规定，那么将旷工三日自动离职判定为合法行为就显得依据不足。此时，旷工三天自动离职的行为虽然不直接构成犯法，但可能会引发劳动纠纷。因为我国法律并未明确规定旷工几天算自动离职，自动离职通常指的是劳动者未与单位协商或提前通知就擅自离岗的行为。

建议：

• 对于劳动者而言，若想离职，应依法提前通知单位，并办理好离职手续，以规避法律风险与纠纷。
• 对于用人单位而言，应依法制定并公示规章制度，明确旷工等违纪行为的处理方式和后果，以确保规章制度的合法性和有效性。

三、旷工三天自动离职后的工资问题

无论员工是因何种原因离职（包括旷工三天自动离职），用人单位都有义务按照员工以往工作期间所贡献的工作日数量，向其发放相应的薪资报酬。这意味着，雇主不得以员工旷工及自动离职为由拖欠或拒不支付工资。

特殊情况：

• 如果公司规章制度中明确规定了旷工期间不发放工资，且该规定合法有效，那么在这种情况下，旷工的这三天工资就可以被视为已经被扣除。但需要注意的是，扣除后的工资必须保证不低于当地政府所设定的最低工资标准。
• 如果因为员工的旷工行为给企业带来了经济损失，企业有权依据双方签订的劳动合同中的相关条款要求员工进行赔偿。但每月扣除的金额不得超过员工当月工资总额的20%，且扣除后的剩余工资同样需要确保不低于当地政府所设定的最低工资标准。

总结与建议：

旷工三日自动离职是否合法，需根据公司的规章制度是否明确且合法公布来判断。若公司无此明确规定，则不能轻易判定旷工三日自动离职为合法。同时，无论离职原因如何，用人单位都应依法支付员工应得的工资。若您在此方面遇到法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。