旷工三天自动离职不发工资是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律原则与规定
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，只要劳动者为用人单位提供了劳动，无论其后续是否旷工或自动离职，用人单位都应当支付其正常工作期间的工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也明确规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。若用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令。
旷工行为的处理：
- 旷工确实属于违反劳动纪律和用人单位规章制度的行为。用人单位可以依据合法有效的规章制度对旷工行为进行相应处理，如给予警告、罚款等处罚，甚至按照规定解除劳动合同。但这些措施应当合理且符合法律法规，不能与劳动者的过错程度不相适应。
- 特别需要注意的是，用人单位不能因劳动者旷工而剥夺其已付出劳动部分应得的全部工资。如果劳动者的旷工行为给用人单位造成了经济损失，用人单位可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第九十条的规定，要求劳动者承担赔偿责任，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
劳动者维权途径
若用人单位以旷工三天自动离职为由拒绝支付工资，劳动者可以通过以下途径维护自己的合法权益：
协商：
- 首先，劳动者可以尝试与用人单位进行友好协商，明确表明虽然存在旷工自离的情况，但依法仍有权获得已工作天数的劳动报酬。在协商过程中，劳动者应清晰、诚实地说明自身情况和诉求，争取与用人单位达成和解。
投诉：
- 若协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门进行投诉。投诉时需准备好相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明自己在单位的工作情况以及旷工的具体情况。劳动监察部门接到投诉后，会介入调查并督促单位履行支付工资的义务。
劳动仲裁：
- 如果劳动监察部门无法解决问题，劳动者可以申请劳动仲裁。申请前需准备好证明劳动关系存在、工作时间和工作量等材料，如劳动合同、工资条、工作证、考勤记录、工作记录、项目文档、同事证言等。撰写劳动仲裁申请书时，要明确写明自己的基本信息、用人单位的基本信息、仲裁请求（即要求用人单位支付拖欠的工资）、事实和理由等内容。然后向劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请及相关材料，并参与仲裁过程，陈述自己的主张和理由，提供相关证据。
提起诉讼：
- 如果对劳动仲裁的结果不满意，劳动者可以在规定的时间内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，需要遵循民事诉讼的程序和规则，向法院提交起诉状、证据等材料，并参加庭审。
实际建议
- 在实际操作中，劳动者应保留好相关证据，如工作记录、工资条、劳动合同等，以便在维权时提供有力支持。
- 用人单位也应完善内部管理制度，确保工资支付的合规性，避免不必要的法律纠纷。在处理旷工等违纪行为时，应依法依规进行，不得侵犯劳动者的合法权益。
综上所述，旷工三天自动离职不发工资的做法是违法的。用人单位应当依法支付劳动者正常出勤期间的工资，并在解除或终止劳动合同时一次性结清。劳动者在遭遇工资拖欠时，应积极运用法律武器维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。