公司未经法定程序擅自将5天工作制变更为6天工作制，属于违法行为。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、法律法规的明确要求

根据《中华人民共和国劳动法》及《国务院关于职工工作时间的规定》，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。同时，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。这意味着，公司调整工作制度，必须确保不违反这些关于工作时间的强制性规定。

二、公司调整工作制度的合法程序

用人单位变更工作制度等涉及劳动者切身利益的重大事项，应当与工会或者职工代表平等协商确定，并公示或者告知劳动者。若公司未经此法定程序，擅自将5天工作制变更为6天工作制，则属于违法行为。劳动者有权拒绝这种未经协商的变更，并要求用人单位按照原劳动合同履行。

三、公司调整工作制度后的加班与报酬问题

如果公司安排劳动者在6天工作制下超时加班，却未依法支付足额加班工资，也侵害了劳动者的权益。根据法律规定，用人单位安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资百分之一百五十的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资百分之二百的工资报酬。

四、劳动者的维权途径

若公司未经法定程序擅自变更工作制度，或未依法支付加班工资，劳动者可通过以下途径维护自身合法权益：

1. 与公司协商：尝试与公司就工作制度变更或加班工资问题进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，劳动者可向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理公司的违法行为。
3. 申请劳动仲裁：劳动者还可向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司恢复原工作制度、支付加班工资等。

建议：公司在考虑调整工作制度时，务必遵循法律法规的明确要求，履行与工会或职工代表的协商程序，并确保劳动者的休息休假权利和加班报酬得到保障。若劳动者遇到公司未经法定程序擅自变更工作制度或未依法支付加班工资的情况，应及时采取措施维护自身合法权益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。