员工向公司借款未还，不可以直接当做工资来处理。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律性质与税务处理

1. 借款与工资的法律性质不同：

   • 借款是员工与公司之间的债权债务关系，员工有义务按照约定的期限和方式归还借款。
   • 工资是员工为公司提供劳动后应得的报酬，是公司对员工劳动的认可和补偿。

2. 税务处理差异：

   • 根据《财政部、国家税务总局关于企业为个人购买房屋或其他财产征收个人所得税问题的批复》(财税〔2008〕83号)的规定，企业其他人员（包括员工）向企业借款，用于购买房屋及其他财产，且借款年度终了后未归还的，应视为企业对个人进行了实物性质的分配，按照“工资、薪金所得”项目计征个人所得税。但这里的关键是借款用于购买财产且未归还，并不等同于可以直接将借款视为工资。
   • 如果员工借款并未用于购买财产，或者虽然用于购买财产但已归还，那么就不能将借款视为工资，也不能按照“工资、薪金所得”项目计征个人所得税。

二、实际操作与风险

1. 实际操作问题：

   • 将员工借款直接当做工资处理，在财务上可能引发混乱，因为借款和工资在会计处理上是两个不同的科目。
   • 这种做法也可能违反公司的财务管理制度和内部控制要求。

2. 法律风险：

   • 如果公司未经员工同意，擅自将借款视为工资进行扣除或处理，可能构成对员工财产权的侵犯，引发劳动争议或法律纠纷。
   • 此外，如果这种做法被税务机关发现，公司可能面临税务处罚的风险。

三、建议与解决方案

1. 明确借款与工资的界限：

   • 公司应明确区分借款和工资的性质，确保两者在财务和法律上的独立性。
   • 对于员工借款，应签订明确的借款合同，约定借款期限、利率和还款方式等条款。

2. 合法合规处理：

   • 如果员工借款未还，公司应通过合法途径进行追讨，如发送催款通知、提起诉讼等。
   • 不得擅自将借款视为工资进行扣除或处理，以免引发法律风险和财务混乱。

3. 加强内部管理：

   • 公司应建立健全的财务管理制度和内部控制机制，确保借款和工资的合规处理。
   • 加强对员工的财务教育和培训，提高员工的财务意识和法律意识。

综上所述，员工向公司借款未还，不可以直接当做工资来处理。公司应明确区分借款和工资的性质，通过合法途径进行追讨，并加强内部管理以防范法律风险。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。