结论前置：购房合同上写明土地证已抵押，并且有抵押权人同意转让书，并不意味着房子一定会被拍卖。是否会被拍卖取决于多个因素，包括债务是否得到清偿、抵押权是否得到实现等。

详细分析：

1. 抵押与转让的关系：

   • 购房合同上注明土地证已抵押，说明该房产所在的土地已经作为抵押物，为某笔债务提供了担保。
   • 抵押权人同意转让书表明，抵押权人同意在债务未清偿的情况下，该房产可以进行转让。但这并不意味着抵押权被解除，也不意味着房产不会被拍卖。

2. 房产被拍卖的条件：

   • 如果债务人（通常是房产的原始买家或开发者）未能按时清偿债务，抵押权人有权依据法律规定，通过法律程序对抵押物（即房产）进行拍卖，以实现其债权。
   • 拍卖是抵押权人实现债权的一种方式，但不是唯一方式。抵押权人也可以选择与债务人协商其他还款方式，如延期还款、债务重组等。

3. 购房者的风险与应对：

   • 对于购房者而言，购买已抵押的房产存在一定风险。如果债务未得到清偿，房产有可能被拍卖，导致购房者面临失去房产的风险。
   • 购房者应在购房前仔细审查购房合同和抵押情况，确保了解所有潜在风险。
   • 如果可能，购房者可以要求卖家提供债务清偿证明或解除抵押的证明，以降低风险。

4. 法律建议：

   • 购房者在购买已抵押的房产时，应咨询专业律师，对购房合同和抵押情况进行全面审查。
   • 如果购房者已经购买了这样的房产，并且面临房产被拍卖的风险，应尽快咨询律师，了解自身权益和可能的法律救济途径。

综上所述，购房合同上写明土地证已抵押，并且有抵押权人同意转让书，并不意味着房子一定会被拍卖。但购房者应充分了解潜在风险，并在必要时咨询专业律师以获取法律帮助。