拆迁时按房屋实际面积测量并双方签订协议，在符合法律规定和程序的前提下，是合法的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、合法性基础

1. 法律依据：

   • 根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》等相关法律法规，房屋拆迁补偿应当遵循公平、公正、公开的原则，确保被征收人的合法权益得到保障。其中，房屋面积的测量是确定补偿金额的重要依据之一。
   • 法律法规并未明确规定必须采用何种测量方式，但要求测量过程应当科学、合理、准确，且不得损害被征收人的合法权益。因此，按房屋实际面积测量并签订协议，在符合法律法规要求的前提下，是合法的。

2. 协议效力：

   • 双方签订的拆迁补偿协议，只要内容合法、双方意思表示真实，且不违反法律法规的强制性规定，即具有法律效力。这意味着，一旦协议签订，双方均应按照协议约定履行各自的义务。

二、可能存在的风险点及防范措施

1. 测量准确性：

   • 风险点：如果测量过程不科学、不合理，或者存在人为操作失误，可能导致测量结果不准确，进而影响补偿金额的合理性。
   • 防范措施：建议选择具有专业资质和经验的测量机构进行房屋面积测量，并确保测量过程公开、透明，接受被征收人的监督。同时，可以在协议中明确测量结果的确认方式和争议解决机制。

2. 协议内容合法性：

   • 风险点：如果协议内容违反法律法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等情形，可能导致协议无效或被撤销。
   • 防范措施：在签订协议前，应仔细审查协议内容，确保其符合法律法规的要求。如有疑问，可以咨询专业律师进行法律审查。同时，要确保双方意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。

三、实际操作建议

1. 了解相关法律法规：

   • 在拆迁过程中，被征收人应主动了解相关法律法规和政策规定，确保自己的合法权益得到保障。

2. 积极参与测量过程：

   • 被征收人应积极参与房屋面积的测量过程，对测量结果进行确认和监督。如有异议，可以及时提出并要求重新测量。

3. 谨慎签订协议：

   • 在签订拆迁补偿协议前，被征收人应仔细阅读协议内容，确保其符合自己的意愿和法律法规的要求。如有疑问或需要修改的地方，可以及时与征收方进行沟通协商。

4. 保留相关证据：

   • 在拆迁过程中，被征收人应保留好与拆迁相关的所有证据材料，如测量报告、协议文本、沟通记录等。这些证据材料在后续可能发生的争议解决中具有重要的证明作用。

总结与建议：拆迁时按房屋实际面积测量并双方签订协议，在符合法律规定和程序的前提下是合法的。但为了确保自己的合法权益得到充分保障，被征收人应积极参与测量过程、谨慎签订协议，并保留好相关证据材料。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。