一个公司通常不能随意设定两种底薪，但在特定情况下，如不同岗位或地区存在差异时，可能存在不同的底薪标准。以下是对此问题的详细分析：

1. 底薪设定的基本原则

底薪，作为员工基本工资的一部分，通常应当遵循公平、合理且符合法律法规的原则。在一般情况下，公司对于同一岗位、同一工作地点的员工，应当设定相同的底薪标准，以确保员工之间的公平性和避免潜在的劳动纠纷。

2. 可能存在不同底薪的情况

• 不同岗位：公司可以根据不同岗位的工作性质、技能要求、市场薪资水平等因素，设定不同的底薪。例如，技术岗位和管理岗位可能由于技能要求和职责不同，而设定不同的底薪标准。
• 不同地区：对于在全国或全球范围内运营的公司，由于不同地区的生活成本、经济发展水平等因素的差异，公司可能会根据当地情况设定不同的底薪标准。这种做法在跨国公司或全国性企业中较为常见。
• 特殊情况：在某些特殊情况下，如员工因个人原因（如残疾、特殊技能等）与公司协商达成不同的底薪标准，也是可能的。但这种情况需要双方协商一致，并符合相关法律法规的规定。

3. 法律合规性

无论公司设定多少种底薪标准，都必须确保这些标准符合相关法律法规的规定。例如，底薪不得低于当地最低工资标准，且应当与员工的岗位、技能、工作经验等因素相匹配。此外，公司在设定底薪时，还应当遵循平等、自愿、协商一致的原则，避免歧视性待遇和不当劳动条件。

4. 潜在风险与建议

• 风险：如果公司随意设定不同的底薪标准，且没有合理的解释和依据，可能会引发员工之间的不满和纠纷，甚至可能导致劳动争议和法律诉讼。
• 建议：公司在设定底薪时，应当充分考虑岗位、地区、市场薪资水平等因素，确保底薪标准的公平性和合理性。同时，公司还应当与员工进行充分的沟通和协商，确保双方对底薪标准有清晰的认识和共识。

如有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况，提供专业、全面的法律服务。