结论：公司上班吸烟超过一分钟罚款200元是否合理，需结合公司规章制度合法性、罚款依据合理性、罚款金额合理性三方面综合判断，以下为具体分析：

1. 公司规章制度合法性

根据《劳动合同法》第四条，用人单位制定涉及劳动者切身利益的规章制度（如罚款、考勤等），需经民主程序（与职工代表大会或全体职工讨论）并公示告知劳动者。

• 若公司未履行民主程序或未公示：该罚款制度可能因程序违法而无效，员工有权拒绝执行。
  
• 若公司已履行程序并公示：需进一步审查罚款依据是否合理。

2. 罚款依据合理性

公司罚款需有明确法律依据或合同约定：

• 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位仅在劳动者因本人原因造成经济损失时，可要求赔偿，且每月扣除部分不得超过当月工资的20%。吸烟行为通常不直接造成经济损失，公司以此为由罚款缺乏直接法律依据。
  
• 合同约定：若劳动合同或规章制度中明确约定“吸烟罚款”条款，需审查条款是否显失公平（如罚款金额过高）。根据《民法典》第四百九十七条，显失公平的条款可能被认定无效。

3. 罚款金额合理性

即使公司有权罚款，金额也需合理：

• 比例原则：罚款金额应与违规行为性质、后果成比例。吸烟1分钟罚款200元，可能被认定为“过重处罚”，违反《行政处罚法》中“过罚相当”原则（虽企业罚款不适用该法，但可参照其精神）。
  
• 地方规定：部分地区（如深圳）明确规定企业罚款上限（如不超过当月工资的20%），若超出可能被认定违法。

4. 员工维权建议

• 协商解决：可与公司沟通，要求撤销或调整罚款。
  
• 投诉举报：向当地劳动监察部门投诉（如12333热线），主张公司罚款违法。
  
• 仲裁诉讼：若公司坚持罚款，可申请劳动仲裁，要求返还罚款并赔偿损失。

总结：公司罚款需同时满足“程序合法+依据合理+金额适当”三要件，否则可能被认定违法。建议员工先核实公司规章制度是否合法，再根据情况选择维权方式。如有进一步疑问，可直接向我咨询。