甲方自愿废标，若乙方不同意，应首先审查废标理由是否合法合规，并依据相关法律法规及合同约定采取应对措施。以下是我的详细分析：

一. 审查废标理由的合法性

1. 依据招标投标法律法规：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关实施条例，废标需基于法定事由，如投标文件不符合招标文件要求、投标人资格不符等。甲方若自愿废标，需确保其理由符合法律法规规定。

2. 审查招标文件及合同：招标文件及合同中可能包含关于废标的具体条款，乙方应仔细审查这些条款，判断甲方废标理由是否与合同约定相符。

• 例如，若招标文件中明确规定在某些特定情况下甲方有权废标，且当前情况确实符合该规定，则甲方废标行为可能合法。

二. 采取应对措施

1. 与甲方沟通协商：若认为甲方废标理由不充分或不合法，乙方可与甲方进行沟通协商，表达自身立场和观点，争取甲方重新考虑或修改废标决定。

2. 依据合同约定寻求救济：若沟通无果，且合同中约定了争议解决机制（如仲裁或诉讼），乙方可根据合同约定寻求法律救济，维护自身合法权益。

3. 向相关监管部门投诉：若甲方废标行为涉嫌违法违规，乙方还可向相关监管部门（如招标投标监管部门）投诉，请求监管部门介入调查并作出处理。

三. 总结与建议

综上所述，面对甲方自愿废标而乙方不同意的情况，乙方应首先审查废标理由的合法性，并依据法律法规及合同约定采取相应应对措施。在沟通协商无果的情况下，可依据合同约定寻求法律救济或向相关监管部门投诉。我建议乙方在采取任何行动前，务必仔细审查相关法律法规及合同约定，确保自身行为的合法性和有效性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。