若担保人和债权人之间有仲裁条款，而债权人一并起诉债务人和担保人时，法院对担保人的处理会依据具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一、仲裁条款对担保纠纷管辖的影响
仲裁条款的效力：
- 仲裁条款是合同双方约定将争议提交仲裁解决的条款，具有排除法院管辖权的效力。若担保合同中明确约定了仲裁条款，则担保合同当事人之间的纠纷应通过仲裁解决。
法院对约定仲裁条款的合同当事人无管辖权：
- 根据相关法律规定，人民法院对约定仲裁条款的合同当事人之间的纠纷无管辖权。这意味着，如果债权人仅起诉担保人，且担保合同中存在有效的仲裁条款，法院将不会受理该案件，而是会告知债权人向约定的仲裁机构申请仲裁。
二、债权人一并起诉债务人和担保人的处理
根据主合同确定管辖法院：
- 当债权人一并起诉债务人和担保人时，应当根据主合同（即债权人与债务人之间的合同）确定管辖法院。这是因为主合同和担保合同在法律上通常被视为一个整体，担保合同的存在是为了保障主合同的履行。
担保合同仲裁条款对整体案件的影响：
- 尽管担保合同中存在仲裁条款，但这并不影响法院对主合同纠纷的管辖。法院在受理此类案件时，会分别处理主合同纠纷和担保合同纠纷。主合同纠纷将按照法院的诉讼程序进行审理，而担保合同纠纷则可能因仲裁条款的存在而被排除在法院管辖之外。然而，在实际操作中，由于主合同和担保合同的紧密关联性，法院可能会在处理主合同纠纷时，对担保合同的相关问题进行一并考虑和裁决，但这并不改变担保合同纠纷应通过仲裁解决的基本原则。如果担保人坚持仲裁，且仲裁条款有效，那么关于担保人的部分责任认定可能需要通过仲裁程序来确定，法院在判决中可能会注明这一点，并待仲裁结果出来后，再对整体案件进行最终裁决或者根据仲裁结果调整判决内容。
三、实际操作中的建议
审查合同条款：
- 在签订合同时，债权人应仔细审查主合同和担保合同中的争议解决条款，确保它们之间的一致性和协调性。如果发现主合同和担保合同在争议解决方式上存在冲突，应及时与对方协商修改，以避免后续纠纷。
选择合适的争议解决方式：
- 根据案件的具体情况和当事人的需求，选择合适的争议解决方式。如果希望快速解决纠纷且成本较低，可以考虑选择仲裁；如果希望获得更全面的司法保障和更强的执行力，则可以选择诉讼。
咨询专业律师：
- 在处理涉及仲裁条款和诉讼管辖的复杂法律问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据案件的具体情况和相关法律法规，为当事人提供全面的法律分析和建议，帮助当事人制定合理的诉讼策略。
总结来说，当担保人和债权人之间有仲裁条款，而债权人一并起诉债务人和担保人时，法院对担保人的处理会受到仲裁条款的影响。在实际操作中，应根据主合同确定管辖法院，并分别处理主合同纠纷和担保合同纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。