小孩的父亲不能仅凭亲子鉴定直接起诉“小三”，但可以根据具体情况，通过不同的法律途径来维护自身及孩子的合法权益。以下从不同角度进行分析：
一、亲子鉴定与起诉“小三”的直接关联性
亲子鉴定主要用于确认亲子关系，它本身并不能直接作为起诉“小三”的法律依据。在法律上，起诉一个人需要基于具体的违法行为或侵权行为，而单纯的亲子关系确认并不构成对“小三”的起诉理由。
二、可能的法律途径及依据
如果“小三”的行为构成重婚：
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百五十八条，有配偶而重婚的，或者明知他人有配偶而与之结婚的，处二年以下有期徒刑或者拘役。
- 操作建议：若小孩的父亲能证明“小三”明知其有配偶仍与之保持不正当关系，并构成重婚事实（如以夫妻名义共同生活），则可以向公安机关报案，由公安机关立案侦查，并可能提起刑事诉讼。此时，亲子鉴定可以作为证明亲子关系及重婚事实的一部分证据，但并非唯一证据。
如果“小三”的行为不构成重婚，但侵犯了小孩父亲的合法权益（如名誉权、隐私权等）：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于人格权的规定，任何组织或者个人不得以侮辱、诽谤等方式侵害他人的名誉权；不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。
- 操作建议：若“小三”的行为侵犯了小孩父亲的名誉权或隐私权，小孩父亲可以提起民事诉讼，要求“小三”承担侵权责任。此时，亲子鉴定可能作为证明亲子关系及侵权行为关联性的证据之一。
关于小孩的抚养权及抚养费问题：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于婚姻家庭的规定，父母对子女有抚养教育的义务。非婚生子女享有与婚生子女同等的权利。
- 操作建议：若小孩父亲希望争取小孩的抚养权或要求“小三”支付抚养费，可以提起民事诉讼。在此过程中，亲子鉴定是确认亲子关系的关键证据，但起诉的对象通常是小孩的生母（即“小三”），且起诉的理由是要求其履行抚养义务，而非单纯因为其是“小三”。
三、实际操作中的注意事项
- 证据收集：在提起任何诉讼之前，小孩的父亲需要收集充分的证据来支持其主张。这包括但不限于亲子鉴定报告、通信记录、证人证言等。
- 法律程序：提起诉讼需要遵循一定的法律程序，包括撰写起诉状、提交证据、参加庭审等。小孩的父亲可以寻求专业律师的帮助，以确保其权益得到充分保护。
- 心理准备：涉及此类纠纷的诉讼往往耗时较长，且可能对当事人的心理造成一定影响。因此，小孩的父亲需要做好充分的心理准备。
总结来看，小孩的父亲不能仅凭亲子鉴定直接起诉“小三”，但可以根据具体情况选择合适的法律途径来维护自身及孩子的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，可以直接向我咨询。