可以离职，但离职原因及后续权益保障需根据具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：
一、从劳动合同解除的角度
劳动者有权解除劳动合同：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。因此，无论公司车辆是否违法改装，你都有权选择离职，只需按照法律规定提前通知用人单位即可。
公司违法行为可能成为解除劳动合同的合法理由：
- 如果公司车辆违法改装的行为严重违反了法律法规，且这种违法行为直接影响到你的工作环境、安全或健康，你可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条，以“用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全”为由，立即解除劳动合同，而无需提前通知。但需要注意的是，这一理由的适用需要严格符合法律规定的情形，即违法行为必须直接危及到你的人身安全。
二、从劳动者权益保障的角度
离职不影响你主张其他权益：
- 如果你选择离职，这并不影响你主张因公司违法行为而可能遭受的其他权益损失，如因公司车辆违法改装导致的工伤赔偿、经济补偿等。你可以在离职后，通过劳动仲裁或诉讼等法律途径，维护自己的合法权益。
注意收集证据：
- 在离职前或离职过程中，建议你注意收集与公司车辆违法改装相关的证据，如照片、视频、证人证言等。这些证据将有助于你在后续的法律程序中证明公司的违法行为，从而更好地维护自己的权益。
三、从实际操作的角度
与公司协商：
- 在决定离职前，你可以尝试与公司进行协商，表达你对公司车辆违法改装行为的担忧和不满，并要求公司采取措施进行整改。如果公司能够积极回应并整改，你可以考虑继续留在公司工作。
向相关部门举报：
- 如果你认为公司车辆违法改装的行为严重违反了法律法规，且公司拒绝整改或整改不力，你可以向当地交通管理部门或劳动监察部门进行举报。这些部门将依法对公司进行调查和处理，从而保护你的合法权益。
建议：在决定离职前，请务必考虑清楚自己的离职原因和后续权益保障问题。如果你认为公司车辆违法改装的行为已经严重影响到你的工作环境、安全或健康，且公司拒绝整改或整改不力，那么你可以选择离职并依法维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。