开发商将两房改为三房是否合法，需分情况讨论：
若开发商在报建、规划及验收阶段均按两房结构进行，且未在合同中明确约定可改造为三房：
- 开发商在销售时宣传“两房改三房”，可能构成虚假宣传或误导消费者。根据《消费者权益保护法》，消费者有权要求开发商承担相应的法律责任，如赔偿损失、解除合同等。
- 若开发商鼓励或指示业主在装修过程中自行改造为三房，且改造部分未经过规划部门批准或涉及改变房屋承重结构，则这种行为可能违反《城乡规划法》和《建筑法》中关于房屋结构安全的规定。业主若按此改造，可能面临房屋被认定为违建、被要求拆除或罚款的风险。
若开发商在报建时虽按两房结构进行，但规划或设计上预留了改造为三房的可能性（如大开间设计，具备隔断条件）：
- 开发商在销售时若明确告知购房者可通过合法装修实现三房功能，并提供了相应的装修指导或建议，且改造不违反房屋结构安全规定，则这种行为可能不构成违法。但开发商需确保其宣传内容真实、准确，不误导消费者。
- 业主在装修时，应严格按照开发商提供的指导或建议进行，确保改造部分符合规划、消防等要求，避免因私自改造而引发法律问题。
法律建议：
- 购房前：购房者应仔细审查开发商的宣传资料、合同条款及规划图纸，确保对房屋结构、功能及改造可能性有充分了解。若开发商宣传“两房改三房”，应要求其在合同中明确约定，并了解改造的具体条件和限制。
- 购房后：若购房者打算对房屋进行改造，应先向开发商或物业管理部门咨询改造的可行性和合法性，并按照相关规定向规划部门申请批准。避免因私自改造而引发法律纠纷或安全隐患。
- 遇到问题：若购房者发现开发商存在虚假宣传或误导行为，或因私自改造而面临法律问题，应及时向相关部门投诉或寻求法律援助，以维护自身合法权益。
可能后果：
- 若开发商的行为构成虚假宣传或误导消费者，可能面临行政处罚或民事赔偿。
- 若业主私自改造房屋结构且未经过规划部门批准，可能面临房屋被认定为违建、被要求拆除或罚款的风险。同时，若改造部分影响房屋结构安全，还可能对业主自身及他人的人身安全造成威胁。
总之，开发商将两房改为三房是否合法，需根据具体情况进行判断。购房者在购房前应充分了解相关信息和规定，避免因信息不对称或误解而引发法律问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。