违规获取工程转让所得，根据情节轻重和违法性质，可能面临行政处罚、民事赔偿以及刑事处罚，具体处理方式如下：

1. 行政处罚
   若违规行为违反《建筑法》《招标投标法》等行政法规，主管部门（如住建部门）可责令改正，没收违法所得，并处以罚款。例如：

   • 转让方未履行法定程序擅自转让工程，可能被处以工程合同价款一定比例的罚款；
     
   • 受让方无资质承接工程，可能被责令停业整顿、降低资质等级或吊销资质证书。
     法律依据：《建筑法》第六十五条、第六十七条。

2. 民事赔偿
   若违规转让导致合同相对方（如发包方、分包方）损失，需承担民事赔偿责任。例如：

   • 转让方未按约定完成工程，需赔偿发包方工期延误、质量不合格等损失；
     
   • 受让方因资质问题导致工程被叫停，需赔偿转让方已投入成本的损失。
     法律依据：《民法典》第五百七十七条（违约责任）、第五百八十四条（损害赔偿范围）。

3. 刑事处罚
   若违规行为涉嫌犯罪（如行贿、受贿、串通投标等），可能被追究刑事责任。例如：

   • 转让方通过行贿获取工程转让许可，可能构成行贿罪；
     
   • 受让方与转让方串通压低转让价格，损害国家利益，可能构成串通投标罪。
     法律依据：《刑法》第一百六十四条（行贿罪）、第二百二十三条（串通投标罪）。

建议行动：

• 立即停止违规行为，评估违法情节（如金额、次数、后果）；
  
• 主动向主管部门说明情况，配合调查，争取从轻处理；
  
• 梳理合同关系，与相关方协商解决民事纠纷；
  
• 若涉及刑事风险，及时委托律师介入，避免自证其罪。
  

提示：工程转让需严格遵守法定程序（如经发包方同意、受让方具备资质），否则可能面临多重法律风险。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。