关于您在公司工作十一年后检查身体不合格能否获得赔偿以及赔偿金额的问题，这并非一个可以直接给出具体数额的简单问题，而是需要根据具体情况进行详细分析。以下是我从不同角度为您提供的分析：
一、是否构成工伤
若身体不合格与工作有关：
- 根据《工伤保险条例》，如果您的身体不合格是由于工作原因导致的职业病或工伤，那么您有权申请工伤认定，并根据认定结果享受相应的工伤保险待遇。
- 工伤保险待遇包括医疗费、康复费、住院伙食补助费、交通食宿费、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金、伤残津贴、一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金等。具体数额需根据您的伤残等级、工资水平、地区标准等因素确定。
若身体不合格与工作无关：
- 如果您的身体不合格并非由于工作原因导致，而是由于个人健康问题或其他非工作因素，那么通常不构成工伤，您无法直接通过工伤保险获得赔偿。
- 但您可能享有医疗保险等其他社会保障，或者根据与公司的劳动合同、公司规章制度等，看是否有关于健康检查、疾病治疗等方面的特别约定。
二、赔偿金额的计算
工伤赔偿：
- 如果构成工伤，赔偿金额将依据《工伤保险条例》及地方实施细则进行计算。例如，一次性伤残补助金的标准为：一级伤残为27个月的本人工资，二级伤残为25个月的本人工资，以此类推，十级伤残为7个月的本人工资。
- 伤残津贴、一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金等也有具体的计算标准，需根据您的实际情况和地区标准进行确定。
- 计算公式示例（以一次性伤残补助金为例）：
- 一次性伤残补助金 = 本人工资 × 伤残等级对应的月数
- 假设您为十级伤残，月工资为5000元，则一次性伤残补助金 = 5000元 × 7个月 = 35000元
非工伤赔偿：
- 如果不构成工伤，赔偿金额将取决于您与公司之间的约定、公司规章制度、劳动合同以及相关法律法规的规定。
- 例如，如果公司有提供健康检查的义务但未履行，导致您未能及时发现并治疗疾病，您可能有权要求公司承担一定的赔偿责任。但具体数额需根据实际情况和法律规定进行确定。
三、建议与行动
及时申请工伤认定：
- 如果您认为身体不合格与工作有关，建议尽快向当地社会保险行政部门申请工伤认定。
收集证据：
- 无论是否构成工伤，都建议您收集相关证据，如医疗记录、工作记录、劳动合同等，以备不时之需。
咨询专业律师：
- 由于劳动纠纷涉及的法律问题较为复杂，建议您在处理过程中咨询专业律师，如我本人，以确保您的权益得到充分保障。
综上所述，您在公司工作十一年后检查身体不合格能否获得赔偿以及赔偿金额，取决于多种因素，包括是否构成工伤、伤残等级、工资水平、地区标准等。如果您有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询。