结论概述：根据新闻背景中的案例，男子追讨两年多加班费，法院最终认定其在休息时间通过社交媒体付出实质性劳动构成加班，公司需支付相应报酬。结合此案例，若公司占用员工休息时间，且员工在此期间付出了实质性劳动，则公司需支付加班费。

以下从几个方面进行详细分析：

一、法律定性

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者在标准工作时间以外付出实质性劳动的，应认定为加班，用人单位需依法支付加班费。新闻背景中的案例明确指出，通过微信等线上工具在休息时间处理工作，若构成实质性劳动，同样属于加班范畴。

二、涉及的法律条文

1. 《中华人民共和国劳动法》第四十四条：有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

   • （一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
   • （二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
   • （三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

2. 关于线上加班的认定：虽然法律条文未直接提及线上加班，但根据劳动法的原则和精神，只要劳动者在标准工作时间以外付出了实质性劳动，无论是在办公室还是通过线上工具，都应认定为加班。

三、可能的法律后果

若公司未依法支付加班费，劳动者有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。法院将根据劳动者提供的证据，如微信聊天记录、邮件往来等，认定加班事实，并判决公司支付相应的加班费。

四、对公众的启示

1. 劳动者：应保留好与加班相关的证据，如微信聊天记录、邮件往来、加班审批记录等，以便在追讨加班费时提供有力支持。
2. 用人单位：应严格遵守劳动法律法规，尊重员工的休息权。即使员工未完成加班审批流程，只要能够证明加班事实的存在，用人单位仍可能被要求支付加班费。同时，用人单位应合理安排员工的工作时间，避免过度占用员工的休息时间。

五、类似情况的预防措施

1. 完善加班制度：用人单位应制定明确的加班制度，包括加班的审批流程、加班费的计算标准等，并确保员工知晓并遵守。
2. 加强沟通与协商：用人单位与员工之间应加强沟通与协商，对于确实需要加班的情况，应提前与员工协商并达成一致意见。
3. 定期审计与监督：用人单位应定期对加班情况进行审计与监督，确保加班费的支付符合法律法规的规定。

举例说明：假设某员工在节假日通过微信处理了公司的工作事务，并保留了相关的微信聊天记录作为证据。若该员工能够证明其在休息时间付出了实质性劳动，且公司未安排补休或支付加班费，则该员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付相应的加班费。

计算公式（以法定节假日加班为例）：

• 法定节假日加班费 = 日工资 × 300% × 加班天数
• 其中，日工资 = 月工资 / 21.75（月计薪天数）

示例计算：假设某员工月工资为10000元，法定节假日加班1天，则其应得的加班费为：10000 / 21.75 × 300% × 1 ≈ 1379.31元。

综上所述，若公司占用员工休息时间，且员工在此期间付出了实质性劳动，则公司需依法支付加班费。劳动者应保留好相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。