租赁合同中注明租金不含税是合法的，但双方需明确税务义务并依法纳税。以下是对此问题的详细分析：
一、法律层面分析
合同自由原则：
- 根据民事合同领域的原则，合同双方当事人有权自行约定租金的构成及是否含税等事项。只要该约定是双方真实意愿的表达，且不存在法定无效情形（如欺诈、胁迫、损害国家利益或社会公共利益），则该约定通常有效。
《中华人民共和国民法典》规定：
- 《民法典》第七百零四条明确了租赁合同应包含租金及其支付期限和方式等条款，虽未直接规定租金是否含税，但租金的约定需符合法律法规的强制性规定。这意味着，虽然合同可以约定租金不含税，但这一约定不能违反税收法律法规的强制性规定。
二、税务层面分析
纳税义务：
- 根据《中华人民共和国个人所得税法》，财产租赁所得应缴纳个人所得税。同时，出租方作为纳税义务人，还需依法缴纳增值税、房产税等其他相关税费。这些纳税义务不因合同中“租金不含税”的约定而免除。
税务风险：
- 税务部门有权对租金收入进行核查，并要求补缴相应税款。若出租方不依法纳税，将面临法律制裁，包括补缴税款、缴纳滞纳金等。此外，不开票即逃税的行为是非法的，可能导致合同无效。
三、实践操作建议
明确约定：
- 在租赁合同中，房东可以写明租金不含税，并注明由此产生的税费由哪一方承担。这样的约定需双方同意并签字确认，以确保其有效性。然而，这并不意味着可以逃避纳税义务。
依法纳税：
- 为避免潜在的法律风险和税务纠纷，当事人在签订租赁合同时应明确租金含税，并依法履行税收义务。如已签订注明租金不含税的合同，建议双方尽快更正合同，明确租金含税，或至少确保合同中的约定不违反税收法律法规，并明确各自的纳税责任。
四、法律后果提示
- 如果出租方未依法纳税，可能面临税务部门的处罚，包括补缴税款、缴纳滞纳金和罚款等。同时，这种行为也可能影响出租方的信用记录，对其未来的经济活动产生不利影响。
- 对于承租方而言，如果明知出租方未依法纳税而继续租赁房屋，也可能承担一定的法律责任。
总结与建议：
虽然租赁合同中可以约定租金不含税，但双方必须遵守税收法律法规的强制性规定，依法履行纳税义务。为确保合同的合法性和有效性，以及避免可能的法律风险，建议在签订租赁合同时明确租金含税，并依法纳税。如果您在房产租赁方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。