计件工资被克扣，劳动者是有权申请劳动仲裁的。以下从法律依据、申请条件、申请流程及注意事项几个方面进行详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条，因劳动报酬等发生的争议适用本法。计件工资作为劳动报酬的一种形式，其克扣行为自然属于劳动争议范畴，劳动者因此有权申请劳动仲裁。同时，《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规也明确规定，用人单位不得非法克扣劳动者的工资，包括计件工资。
二、申请劳动仲裁的基本条件
公司需有明确合理的计件工资制度：
- 公司应制定经民主程序且公示告知劳动者的计件工资制度。
- 劳动者未达到计件标准时，公司按制度扣发工资在合理范围内是合法的。
- 若公司无相关制度、制度不合理或未公示，则扣发工资缺乏依据。
扣发的计件工资数额需合理：
- 扣发数额过高或明显不合理，损害了劳动者的合法权益时，劳动者可以主张返还。
扣发行为需符合法定程序：
- 公司应向劳动者说明扣发的原因和依据，确保程序的合法性。
三、申请劳动仲裁的具体流程
收集证据：
- 包括劳动合同、工资条、银行工资流水、计件工作记录、沟通记录等。
- 这些证据用于证明劳动关系、计件工资约定、工资发放情况、计件工作成果以及与公司沟通的过程。
提交仲裁申请：
- 向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请书及相关证据。
- 仲裁申请书需详细说明申请人和被申请人的基本信息、仲裁请求、事实和理由。
等待受理与审理：
- 仲裁委员会在收到申请后五日内决定是否受理，并通知申请人。
- 受理后，仲裁庭将在开庭五日前通知双方当事人开庭日期和地点。
- 在庭审过程中，双方进行举证、质证和辩论。
接收裁决：
- 仲裁庭自受理之日起四十五日内作出裁决，复杂案件可延期但不超过十五日。
四、注意事项
- 协商优先：在申请劳动仲裁前，建议劳动者先与公司进行协商，尝试通过和解方式解决争议。
- 仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间一般为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。劳动者应确保在时效期内提出申请。
建议：若您的计件工资被克扣，且符合上述申请劳动仲裁的条件，您可以按照上述流程向劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。在申请过程中，务必确保提供的证据充分、真实，以支持自己的主张。同时，也请注意仲裁时效的限制，确保自己的权益得到有效维护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。