关于是否需要在公司留存一份购买的实习章对应的第三方协议，我的建议是：应当留存一份在公司，但具体操作需结合实际情况与法律规定谨慎处理。以下从不同角度为您详细分析：

1. 协议留存的重要性

• 证据留存：第三方协议是证明您与公司之间实习关系、权利义务的重要法律文件。留存一份在公司，可以在发生纠纷时（如工资争议、实习内容不符等）作为证据使用，保护您的合法权益。
• 合规性要求：根据《劳动合同法》及相关规定，虽然实习关系与劳动关系有所不同，但双方仍应签订书面协议明确权利义务。留存协议有助于证明双方已就实习事宜达成一致，符合法律对书面形式的要求。

2. 实际操作中的注意事项

• 协议内容审查：在留存协议前，务必仔细审查协议内容，确保条款合法、合理，无显失公平或违法条款。例如，协议中不应包含要求您支付“实习费”等不合理条款。
• 公司盖章与签字：确保协议已由公司正式盖章，并由您本人签字确认。未经盖章或签字的协议可能无法作为有效证据。
• 多份留存：建议不仅在公司留存一份，您本人也应保留一份协议原件或复印件，以备不时之需。

3. 特殊情况下的处理

• 公司拒绝留存：如果公司拒绝留存您的协议，您可以要求公司出具书面说明，说明拒绝留存的原因，并保留该说明作为证据。同时，您本人应妥善保管协议原件。
• 协议遗失或损坏：如果协议遗失或损坏，您应尽快与公司协商补签或出具书面证明，以证明双方曾就实习事宜达成一致。

4. 法律后果与风险提示

• 无协议的风险：如果没有书面协议，一旦发生纠纷，您可能面临举证困难的问题，导致无法有效维护自己的权益。
• 违法协议的风险：如果协议中包含违法条款（如要求您承担不应承担的费用），您有权拒绝履行，并可以向相关部门投诉或寻求法律援助。

5. 建议与总结

• 留存协议：为了保障您的合法权益，建议您在公司留存一份第三方协议，并确保协议内容合法、有效。
• 咨询与审查：在签订协议前，您可以咨询我或其他专业律师，对协议内容进行审查，确保您的权益得到充分保障。
• 及时维权：如果发生纠纷，您应及时收集证据，并可以通过法律途径维护自己的权益。

最后，我想强调的是，法律文件的重要性不容忽视。在实习过程中，您应时刻关注自己的权益，确保所有协议和文件都符合法律规定。如果您在实习过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。