结论：是否需要将三方协议留一份给公司，这主要取决于协议的具体约定以及公司的内部管理要求，但从法律合规和风险防范的角度，建议将签署完成的三方协议留存一份给公司。
分析说明：
协议约定：
- 三方协议，顾名思义，是涉及三个主体的协议。协议的内容、条款以及各方的权利和义务，均应在协议中明确约定。
- 如果协议中明确规定了各方应留存协议的份数，或者特别指出公司需要留存一份，那么按照协议约定执行即可。
公司内部管理要求：
- 即使协议中没有明确规定，公司出于内部管理、风险防范或法律合规的考虑，也可能要求留存一份三方协议。
- 留存协议有助于公司记录交易细节、明确各方责任，并在未来可能出现的纠纷中作为证据使用。
法律合规与风险防范：
- 从法律合规的角度来看，留存协议是公司履行其法律义务、保护自身权益的一种方式。
- 在商业实践中，协议是各方之间权利义务的书面凭证。留存协议有助于公司在未来可能出现的法律纠纷中，提供有力的证据支持其主张。
特殊场景：
- 如果三方协议中的某一方（非公司方）对留存协议有特别要求，或者协议涉及敏感信息、商业秘密等，公司应在与各方协商一致的基础上，决定是否留存以及如何留存协议。
- 在某些情况下，如协议涉及跨国交易、复杂法律关系或高额金额等，公司可能更需要留存协议以应对可能的法律风险和挑战。
行动建议：
- 与公司法务或相关部门沟通：在签署三方协议前，建议与公司法务或相关部门沟通，了解公司对留存协议的具体要求和流程。
- 明确协议条款：在签署协议时，应仔细阅读协议条款，特别是关于协议留存、保密、争议解决等方面的规定，确保公司权益得到充分保护。
- 妥善保管协议：如果公司决定留存协议，应确保协议的安全保管，防止泄露或丢失。同时，应建立协议管理制度，便于未来查询和使用。
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