是否需要将三方协议交给公司，主要取决于协议的具体内容、个人职业规划以及公司的信誉和管理制度，以下分情况讨论：
需要交给公司的情形
正常入职流程：
- 若三方协议是作为就业协议，由毕业生、用人单位和学校三方共同签订，且你已确定会按协议入职该公司，那么按照常规流程，协议通常需要交给公司一份，以便公司进行后续的入职手续办理和档案管理。这种情况下，协议是保障你就业权益的重要文件，公司留存一份是合理的。
- 实例说明：你通过校园招聘与某公司签订了三方协议，并计划毕业后直接入职该公司。此时，将协议交给公司是入职流程的一部分。
公司要求留存：
- 若公司在签订协议时明确要求留存一份作为备案或管理之用，且协议内容合法、明确，没有损害你的权益，那么按照公司要求交还协议也是合理的。
- 操作建议：在交还协议前，可以与公司确认其留存协议的具体用途和管理方式，以确保你的权益得到保障。
不需要交给公司（或可考虑拿回）的情形
协议存在问题：
- 若发现协议中存在条款表述不清、权利义务不对等、与协商内容不符等问题，应及时与公司沟通协商修改。在修改前或修改过程中，你可以考虑拿回协议或保留一份复印件，以避免公司利用问题条款对你造成不利影响。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同内容应明确、具体，双方权利义务应对等。若协议存在问题，你有权要求修改或解除协议。
职业规划变化：
- 若签订协议后有了更好的职业选择或决定升学、考公等，不打算按协议入职该公司，应与公司协商解除协议。在此情况下，你可以考虑拿回协议或要求公司出具解除协议的证明，以避免承担不必要的违约责任。
- 实例说明：你通过校园招聘与某公司签订了三方协议，但随后又获得了另一家更优质公司的录用通知。此时，你需要与公司协商解除原协议，并拿回或要求公司出具解除证明。
公司信誉或管理问题：
- 若对公司信誉或档案管理制度存在疑虑，担心协议被滥用或遗失，你也可以考虑拿回协议或要求公司提供协议复印件或电子版作为备份。
- 操作建议：在拿回协议前，可以与公司沟通确认其管理制度和信誉情况，并要求公司提供相应的保障措施。
注意事项
- 保留证据：无论是否将协议交给公司，都应保留好协议的复印件或电子版作为证据，以备不时之需。这有助于在发生纠纷时证明你的权益和协议内容。
- 及时沟通：在处理协议问题时，应及时与公司沟通协商，以确保问题得到妥善处理。沟通是解决问题的关键，通过沟通可以明确双方的权利义务和解决方案。
- 法律保护：若遇到协议纠纷或权益受损情况，可寻求法律援助或向相关部门投诉举报。法律是保护你权益的最后一道防线，不要害怕运用法律武器来维护自己的合法权益。
综上所述，是否需要将三方协议交给公司应根据具体情况来判断。在处理过程中，应确保自身权益得到充分保护，并遵守相关法律法规和合同约定。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。