结论前置：公司因配合公安调查而延迟发放员工工资，需分情况讨论其合法性，具体如下：

1. 若延迟发放有明确法律依据或合同约定
   根据《工资支付暂行规定》第七条，工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付。但若因不可抗力（如自然灾害、战争等）或政府行为（如公安调查导致财务系统冻结、账户查封等）导致无法按时支付，且公司能提供公安出具的调查文件、账户冻结证明等证据，可依法延迟发放。此时需注意：

   • 延迟期间不得超过合理期限（通常不超过1个月）；
     
   • 需及时向劳动者说明情况，并保留书面告知记录；
     
   • 恢复支付后需全额补发，不得克扣。

2. 若延迟发放无合法依据，仅因公司主观安排
   若公安调查未直接影响公司财务系统或账户，公司仅以“配合调查”为由单方面延迟发放工资，则构成违法。根据《劳动合同法》第三十八条，劳动者可主张：

   • 要求公司立即支付工资及逾期利息（按同期银行贷款利率计算）；
     
   • 若因延迟导致劳动者生活困难，可要求公司赔偿实际损失；
     
   • 严重情况下，劳动者可依据《劳动合同法》第三十八条以“未及时足额支付劳动报酬”为由解除劳动合同，并主张经济补偿金（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。

实务建议：

• 公司应优先通过书面形式（如邮件、公告）向员工说明调查情况及工资延迟原因，并附公安调查文件作为依据；
  
• 若调查导致账户冻结，可与员工协商分期支付或预支部分工资，避免纠纷；
  
• 员工若遇无合法理由的延迟，可向当地劳动监察大队投诉（12333热线），或申请劳动仲裁主张权益。

风险提示：
公司需注意，即使因公安调查延迟发放，也需在合理期限内解决，否则可能面临行政处罚（如劳动部门责令支付+50%-100%赔偿金）及民事赔偿双重风险。建议提前与律师沟通方案，降低法律风险。