在配合调查被限制期间，单位是否需要发工资，这主要取决于被限制的性质以及单位与员工之间的劳动合同或相关法律法规的规定。 以下是从不同角度进行的分析：

1. 如果被限制人身自由是出于刑事强制措施（如拘留、逮捕等）：

   • 在这种情况下，员工实际上无法正常履行工作职责。根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，如果员工因涉嫌犯罪被采取刑事强制措施，且最终被证明无罪或未被追究刑事责任，那么在此期间，单位一般应当按照劳动合同的约定支付工资。但如果员工最终被追究刑事责任，单位则有权依据劳动合同或相关法律法规解除劳动合同，并可能无需支付此期间的工资（具体需看劳动合同约定及地方性法规）。
   • 特殊情况：如果劳动合同中有特别约定，或者地方性法规有特别规定，比如某些地区可能规定在员工被刑事拘留期间，单位可以暂停支付工资，那么应遵循这些特别约定或规定。

2. 如果被限制人身自由是出于行政强制措施（如行政拘留等）：

   • 行政拘留通常较短，且不属于刑事犯罪范畴。在此期间，员工虽然无法到岗工作，但单位一般仍应按照劳动合同的约定支付工资。因为行政拘留并不构成解除劳动合同的法定理由。

3. 如果被限制是出于单位内部的纪律处分或调查需要：

   • 如果这种限制并非由司法机关或行政机关采取，而是单位自行决定的（如停职调查等），那么单位是否需要支付工资，将主要取决于劳动合同的约定以及单位内部的规章制度。如果劳动合同或规章制度中明确规定了在此类情况下单位应支付工资，那么单位就应当遵守。

4. 实际操作建议：

   • 对于员工而言，如果遭遇此类情况，首先应查看自己的劳动合同以及单位内部的规章制度，了解在此类情况下单位是否有支付工资的义务。
   • 如果单位拒绝支付工资，员工可以与单位进行协商，或者向当地的劳动监察部门投诉，甚至通过法律途径来维护自己的合法权益。
   • 对于单位而言，在采取此类限制措施前，应仔细审查劳动合同和规章制度，确保自己的行为符合法律法规的规定，避免因此引发劳动争议。

总结来说，配合调查被限制期间单位是否需要发工资，并没有一个绝对的答案，而是需要根据具体情况来判断。如果对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。