公司应首先核实工资卡无法进账的具体原因，再根据不同情况采取相应处理措施。具体处理方式如下：
核实工资卡状态
公司需确认员工提供的工资卡是否处于正常状态，例如是否被冻结、挂失、注销或存在信息错误（如卡号、姓名、开户行信息不符）。若因员工个人原因导致工资无法入账，公司应要求员工及时更新或补办银行卡，并提供正确的账户信息。
检查公司发放流程
若工资卡状态正常，公司需排查自身发放流程是否存在问题，例如财务系统录入错误、银行代发指令未成功发送、银行处理延迟等。此时，公司应联系银行或财务系统服务商，核实转账记录及失败原因，并及时补发工资。
协商替代支付方式
在问题解决期间，为保障员工权益，公司可与员工协商通过其他方式支付工资，例如现金发放、转账至员工其他有效账户，或暂缓发放并明确补发时间。需注意，替代支付方式需符合劳动合同约定及法律法规要求，避免引发纠纷。
法律责任与合规性
根据《工资支付暂行规定》，用人单位必须以法定货币形式按月支付工资，不得克扣或无故拖欠。若因公司原因导致工资发放延迟，员工有权要求公司支付延迟期间的工资及可能的赔偿。公司应确保处理过程合法合规，避免因程序瑕疵承担法律责任。
建议：公司应建立完善的工资发放核查机制，在每次发放前核对员工账户信息，并保留转账凭证。若问题持续存在，可委托律师审查内部流程，防范法律风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询。