结论前置：针对您提出的“甲减、桥本甲状腺炎、糖尿病跟单位说不上夜班，单位不同意是否可以起诉”的问题，这并非一个可以直接通过起诉解决的问题，而是需要先通过一定的程序和依据来证明您确实不适合上夜班，再与单位进行协商或申请劳动仲裁。以下是从不同角度给出的详细分析。
一、从法律角度分析
劳动者健康权保护：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，劳动者享有获得劳动安全卫生保护的权利，用人单位应当为劳动者提供符合国家规定的劳动安全卫生条件和必要的劳动防护用品，对从事有职业危害作业的劳动者应当定期进行健康检查。
- 如果您的疾病（甲减、桥本甲状腺炎、糖尿病）确实影响到您的夜间工作能力，且经过医学证明，那么您有权要求单位调整工作岗位或工作时间，以避免对您的健康造成进一步损害。
单位义务与劳动者权利：
- 单位有义务根据劳动者的身体状况和工作能力合理安排工作岗位和工作时间。如果单位无视您的健康状况，强行安排您上夜班，可能构成对劳动者权益的侵犯。
- 但在此之前，您需要提供充分的医学证据来证明您确实不适合上夜班。这通常包括医生的诊断证明、建议休息或调整工作时间的医疗意见等。
二、从实际操作角度分析
与单位协商：
- 在采取法律行动之前，建议您首先与单位进行协商，说明您的健康状况和医生的建议，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
- 协商过程中，您可以提出调整工作岗位、工作时间或提供其他合理的便利条件等要求。
申请劳动仲裁：
- 如果协商无果，您可以向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请仲裁时，您需要提交相关证据，包括医学证明、与单位协商的记录等。
- 仲裁委员会将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。如果裁决支持您的请求，单位需要执行裁决结果。
起诉的适用性：
- 在大多数情况下，对于此类劳动争议，起诉并不是首选的解决方式。因为起诉程序相对复杂、耗时较长，且成本较高。
- 只有在劳动仲裁裁决后，单位不执行裁决结果，或者您对仲裁裁决不服时，才可以考虑向法院提起诉讼。
三、建议与注意事项
收集证据：
- 在采取任何行动之前，确保您已经收集了充分的医学证据来证明您确实不适合上夜班。这包括医生的诊断证明、医疗记录、建议休息或调整工作时间的医疗意见等。
保持沟通：
- 在与单位协商或申请劳动仲裁的过程中，保持与单位的良好沟通。尽量以平和、理性的态度表达您的诉求和理由。
寻求专业帮助：
- 如果您在处理此过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业律师或法律援助机构的帮助。他们可以提供更具体的法律建议和指导。
总结：针对您的情况，不建议直接起诉单位。而是应该先通过医学证明来确认您确实不适合上夜班，然后与单位进行协商或申请劳动仲裁来解决问题。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。