台风公司拒绝停工，主要由应急管理部门和劳动行政部门进行监管，并可能涉及公安机关的处罚，具体依据相关法律法规执行。以下从不同角度为您详细分析：
一、监管部门及职责
应急管理部门：
- 在台风等自然灾害预警期间，应急管理部门负责发布和执行相关的防御指令，包括停工、停产等措施。
- 如果公司拒绝执行应急管理部门的停工指令，应急管理部门有权对公司进行处罚，并可能移送司法机关依法处理。
劳动行政部门：
- 劳动行政部门负责监督用人单位遵守劳动法律法规，包括在台风等恶劣天气下保障劳动者的安全和健康。
- 如果公司违反规定，强行要求员工在台风天出勤，劳动行政部门有权对公司进行处罚，如责令限期退还扣减的工资报酬，并处以罚款。
二、相关法律法规
《广东省气象灾害防御条例》：
- 该条例规定，在台风黄色、橙色、红色预警信号生效期间，除必需在岗的工作人员外，用人单位应当根据工作地点、工作性质、防灾避灾需要等情况安排工作人员推迟上班、提前下班或者停工。
- 如果用人单位仍然强行要求员工正常出勤上班，员工可以拒绝，且此行为不构成旷工。
《广东省防汛防旱防风条例》：
- 该条例规定，受台风、暴雨、洪水灾害严重威胁的地区，县级以上人民政府或者其防汛防旱防风指挥机构应当根据受影响的程度和应急预案，宣布采取停课、停工、停产、停运、停业等一项或者多项必要措施。
- 未按照规定停工，构成违反治安管理行为的，由公安机关依照《中华人民共和国治安管理处罚法》给予处罚。
三、法律后果
对公司的处罚：
- 如果公司拒绝停工，造成人员伤亡及财产损失的，应当依法赔偿。
- 对公司法定代表人或实际控制者、实际经营人处以罚款；对直接负责的主管人员或其他直接责任人员也处以罚款。
- 造成人员严重伤亡或重大财产损失，涉嫌犯罪的，移送司法机关依法处理。
对员工的保护：
- 员工在台风天有权拒绝上班，且此行为不构成旷工。
- 如果公司以员工旷工为由对员工进行处罚或辞退，属于违法处罚或违法辞退，员工可以要求申请支付赔偿金。
四、建议与措施
公司应遵守相关法律法规：
- 在台风等恶劣天气下，公司应密切关注气象预警和政府部门的防御指令，及时安排停工、停产等措施，保障员工的安全和健康。
员工应了解自己的权益：
- 员工应了解在台风等恶劣天气下的权益和保护措施，如拒绝上班的权利、不被处罚或辞退的保障等。
及时咨询与维权：
- 如果公司拒绝停工或违反相关规定，员工可以及时向应急管理部门、劳动行政部门或公安机关举报，并咨询专业律师进行维权。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，提供详细的法律建议和解决方案。