厂里自离并不意味着就扣三天工资，这一问题的答案需结合具体情况和法律规定来分析。以下是从不同角度的详细解答：

1. 自离与工资支付的基本原则

• 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。这意味着，劳动者只要付出了劳动，无论是否自离，都有权获得相应的工资报酬。
• 自离可能违反了公司的规章制度，但这并不直接导致工资被扣除。公司若因自离造成损失，需举证证明损失情况，并从工资中扣除合理赔偿费用，而非直接扣除三天工资。

2. 公司规章制度对工资扣除的影响

• 有明确规定的情况：如果公司的规章制度里清晰地写明旷工一天扣除若干工资，并且已向员工公示，让员工知晓该规定，那么在员工自离时，公司扣除相应旷工工资（如三天）有一定的合理性。但扣除后，员工剩余的工资不能低于当地最低工资标准，以保障员工的基本生活权益。
• 无明确规定的情况：若公司规章制度没有明确规定旷工的工资扣除办法，公司随意扣除三天旷工工资就缺乏依据。此时，员工可以先与公司进行协商，提出自己的诉求，争取合理解决。如果协商不成，员工可以向劳动监察部门进行投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

3. 自离后工资的计算与支付

• 自离后，工资的计算通常依据劳动者与用人单位之间的劳动合同约定进行。在大多数情况下，这三天的工资会按照劳动者的日工资或小时工资标准来计算。
• 具体计算方法可能因公司政策和劳动合同的不同而有所差异，但总体原则是按照实际出勤天数和约定的薪资进行计算。如果劳动合同中有明确的薪资计算方式和出勤规定，那么双方应按照合同约定执行。

4. 自离不发工资的处理方式

• 如果劳动者自离后，用人单位拒绝支付应得的工资，劳动者可以采取以下措施来处理：
  • 与用人单位协商解决：劳动者可以尝试与用人单位进行协商，说明自己的权益和要求，寻求双方都能接受的解决方案。
  • 寻求劳动监察部门的帮助：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门介入调查并处理。
  • 申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，劳动者还可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。

总结与建议： 厂里自离并不意味着就扣三天工资。公司是否扣除工资以及扣除多少，需依据公司规章制度的具体情况以及其是否合法合规来判断。如果公司规章制度没有明确规定旷工的工资扣除办法，或者扣除后员工剩余工资低于当地最低工资标准，员工都有权通过合法途径维护自己的权益。因此，建议劳动者在自离前了解公司规章制度，并在自离后积极与公司协商工资支付问题，必要时寻求法律帮助。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。