不合法。根据我国现行法律规定，公司应当按照员工实际工资总额作为社保缴费基数，而非随意降低基数。以下是具体分析：

1. 法律依据
   根据《社会保险法》第六十条及《社会保险费征缴暂行条例》第四条，用人单位应当按员工实际工资总额申报社保缴费基数。若公司故意少报缴费基数（如将1万元工资申报为5千元），属于违法行为。

2. 法律后果

   • 行政处罚：社保部门可责令补缴差额，并处欠缴金额1倍以上3倍以下罚款（《社会保险法》第八十六条）。
     
   • 员工权益受损：社保缴费基数直接影响养老金、医保报销等福利，公司少缴会导致员工未来权益缩水。
     
   • 劳动争议风险：员工可依据《劳动合同法》第三十八条，以“未依法缴纳社保”为由解除劳动合同，并主张经济补偿金。

3. 例外情形
   若当地社保缴费基数存在上下限（如当地社平工资的60%-300%），且员工工资低于下限或高于上限，则按上下限执行。但本案中1万元工资通常高于多数地区下限，公司无权自行调整。

建议行动：

• 保留工资条、劳动合同等证据；
  
• 向公司提出书面异议，要求按实际工资补缴；
  
• 若公司拒绝，可向当地社保稽核部门投诉（12333热线）或申请劳动仲裁。
  

如有进一步细节需核实（如地区政策、合同约定等），可直接向我咨询。