您已经提交了被迫离职通知书，但单位却开具了个人原因离职证明，这种情况下，关键在于证明实际离职原因，并据此维护自身权益。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景与举证责任
根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释(一)》第四十四条的规定，因用人单位作出的开除、除名、辞退、解除劳动合同等决定而发生的劳动争议，用人单位负有举证责任。这意味着，在离职原因存在争议时，用人单位需要提供证据来证明其主张的离职原因。
二、不同情况下的法律后果
若您能证明被迫离职：
- 如果您能提供被迫离职通知书等相关证据，证明您是因为单位的原因（如未按时支付工资、未提供劳动条件等）而被迫离职，那么您有权要求单位支付经济补偿金或赔偿金。
- 在此情况下，单位开具的个人原因离职证明将不被采纳，因为这与实际离职原因不符。
若单位能证明您个人原因离职：
- 如果单位能提供您主动提交的离职申请、与您的沟通记录等证据，证明您是因为个人原因而离职，那么单位将无需支付经济补偿金或赔偿金。
- 在此情况下，您仅以单位出具的离职证明中所述解除理由与个人原因辞职事实不符为由而认为系公司主动解除双方之间的劳动关系，法院将不予支持。
三、建议与行动步骤
收集证据：
- 保留被迫离职通知书的原件或复印件，以及其他能证明您被迫离职的证据（如工资单、工作记录、与单位的沟通记录等）。
- 如果可能，收集单位存在违法行为的证据（如未按时支付工资、未提供劳动条件等）。
与单位协商：
- 尝试与单位进行沟通，说明您的实际离职原因，并要求单位更正离职证明中的内容。
- 如果单位拒绝更正，您可以考虑采取法律手段维护自身权益。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果与单位协商无果，您可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求单位支付经济补偿金或赔偿金。
- 对劳动仲裁结果不服的，您还可以向法院提起诉讼。
四、注意事项
- 在整个过程中，保持冷静和理性，避免与单位发生不必要的冲突。
- 遵循法律程序，不要采取过激行为或违法手段来维护自身权益。
- 如有需要，及时咨询专业律师（比如我），以获取更具体的法律建议和帮助。
最后强调，离职原因的证明对于维护您的合法权益至关重要。因此，请务必妥善保管相关证据，并在必要时采取法律手段来维护自身权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。