工会制度的建立与运行并不需要直接参照控股公司的规定，而是应遵循国家相关的法律法规以及公司内部的规章制度。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律法规的遵循

1. 国家法律法规：工会作为职工自愿结合的工人阶级群众组织，其建立、运行及活动均受到国家法律法规的严格规范。例如，《中华人民共和国工会法》就明确规定了工会的组织原则、权利义务、活动方式等。因此，无论公司是否为控股公司，其工会制度都必须严格遵守这些法律法规。

2. 地方性法规与政策：除了国家层面的法律法规外，不同地区还可能根据本地实际情况制定地方性法规或政策，对工会制度进行进一步细化和补充。公司工会制度在建立时，也需要考虑并遵循这些地方性规定。

二、公司内部规章制度的制定

1. 独立性与自主性：每个公司都有其独特的经营环境、文化背景和职工需求，因此，在制定工会制度时，公司应充分考虑自身的实际情况，制定出符合自身特点的规章制度。这些制度应体现公司的独立性和自主性，而不必完全参照控股公司的规定。

2. 民主程序与职工参与：工会制度的制定过程应充分体现民主原则，广泛征求职工的意见和建议。通过职工代表大会或其他民主形式，确保工会制度能够真正反映职工的意愿和需求。这一过程与控股公司无关，而是公司内部民主管理的重要体现。

三、控股公司的影响与限制

1. 间接影响：虽然控股公司可能通过股权控制、管理指导等方式对公司产生一定影响，但这种影响并不直接延伸到工会制度的制定上。控股公司可以提出建议或意见，但最终决定权仍在于公司本身。

2. 法律边界：控股公司不得利用其控股地位干预公司工会制度的独立性和自主性。任何试图通过控股地位强制公司参照其工会制度的行为，都可能构成对法律法规的违反，并受到相应的法律制裁。

四、实际操作中的建议

1. 深入了解法律法规：在制定工会制度前，公司应深入了解国家及地方的相关法律法规，确保工会制度的合法性和合规性。

2. 广泛征求职工意见：通过问卷调查、座谈会等形式，广泛征求职工对工会制度的意见和建议，确保制度能够真正反映职工的意愿和需求。

3. 保持独立性与自主性：在制定工会制度时，公司应保持其独立性和自主性，不必完全参照控股公司的规定。同时，也要考虑控股公司的合理建议，以促进公司的和谐发展。

如有任何关于公司法务或工会制度的疑问，欢迎直接向我咨询。我将以专业的知识和丰富的经验，为你提供全面、准确的法律解答。