店长恶意调休不让上班，员工可以首先尝试与店长沟通解决，若沟通无果，可以向公司的人事部门或上级领导反映情况，还可以向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，乃至提起诉讼。下面我根据相关法律法规为你详细分析：

一. 沟通解决

• 店长恶意调休可能出于多种原因，首先应与店长进行坦诚沟通，了解调休的具体原因，并表达自己的诉求和困难。
• 通过沟通，双方可能达成理解，从而解决调休问题。

二. 向公司人事部门或上级领导反映

• 如果与店长的沟通没有结果，员工可以向公司的人事部门或上级领导反映店长的行为。
• 公司内部通常会有相应的管理制度和投诉渠道，员工可以合理利用这些资源来维护自己的权益。

三. 向劳动监察部门投诉

• 根据《劳动法》的相关规定，劳动者享有休息和休假的权利，店长恶意调休可能侵犯了员工的这一权利。
• 员工可以向当地的劳动监察部门投诉店长的行为，劳动监察部门会对投诉进行调查，并根据调查结果采取相应的措施。

四. 申请劳动仲裁

• 如果劳动监察部门的处理未能满足员工的诉求，员工还可以根据《劳动争议调解仲裁法》申请劳动仲裁。
• 劳动仲裁委员会将依法进行裁决，维护员工的合法权益。

五. 提起诉讼

• 在某些情况下，如果劳动仲裁结果仍未能满足员工的诉求，员工还可以选择向人民法院提起诉讼。
• 人民法院将依法进行审理，并作出公正的判决。

我建议，在采取任何法律手段之前，员工应尽可能收集相关证据，如与店长的沟通记录、调休通知、工作记录等，以便在需要时提供证明。同时，保持冷静和理性，避免与店长发生不必要的冲突。如有进一步需要，您可以继续咨询我。