个体工商户转让后解除员工赔偿应由转让后的经营者负责。具体分析如下：

一. 赔偿责任归属

1. 个体工商户的法律地位：个体工商户是依法经核准登记，从事工商业经营的家庭或个人。在个体工商户转让后，其经营权及相关的权利义务也随之转让给新的经营者。
2. 劳动合同关系的连续性：员工与个体工商户之间的劳动合同关系，在个体工商户转让后，通常视为由新的经营者承继。因此，若转让后解除员工，赔偿责任应由新的经营者承担。

二. 法律依据

1. 《中华人民共和国劳动合同法》相关规定：虽然《劳动合同法》中未直接规定个体工商户转让后的赔偿责任归属，但根据劳动合同关系的连续性原则，以及个体工商户的法律地位，可以推断出赔偿责任应由转让后的经营者承担。
2. 《中华人民共和国民法总则》相关规定：根据《民法总则》（现已被《民法典》替代，但原理相同）关于个体工商户的规定，个体工商户的债务，个人经营的，以个人财产承担；家庭经营的，以家庭财产承担。在个体工商户转让后，其债务（包括员工赔偿）也应由新的经营者承担。

三. 实际操作建议

1. 明确转让协议内容：在个体工商户转让时，双方应明确转让协议中的内容，包括员工安置、赔偿责任等条款，以避免后续纠纷。
2. 及时办理变更登记：转让后应及时办理工商变更登记，确保新的经营者能够合法地承继个体工商户的权利义务。

综上所述，个体工商户转让后解除员工赔偿应由转让后的经营者负责。这是基于劳动合同关系的连续性原则以及个体工商户的法律地位所得出的结论。如有进一步需要，您可以继续咨询我。