针对事业单位人员常年旷工却仍领取工资的情况，处理方式需结合法律法规、单位规章制度及具体情节综合判断。以下是分情况说明：

1. 单位有权追回违规发放的工资

• 法律依据：根据《事业单位人事管理条例》第十五条，事业单位工作人员应遵守单位规章制度，旷工属于严重违反工作纪律的行为。若单位规章制度明确规定旷工期间停发工资，或劳动合同中有类似约定，单位有权要求员工返还旷工期间已领取的工资。
• 操作建议：单位应先通过书面形式（如《返还款项通知书》）要求员工返还违规工资，并保留送达证据（如签收记录、邮寄凭证）。若员工拒绝，单位可向劳动仲裁委员会申请仲裁，或直接向法院提起民事诉讼。

2. 单位可依据规定解除劳动合同

• 法律依据：根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第十七条，连续旷工超过15个工作日，或1年内累计旷工超过30个工作日的，事业单位可以给予开除处分。若员工被开除，其与单位的劳动关系终止，单位无需再支付工资，且可追回旷工期间已发放的工资。
• 操作建议：单位需确保解除程序合法，包括：
  1. 查实旷工事实（如考勤记录、同事证言）；
  2. 通知员工并听取其陈述申辩；
  3. 作出书面处分决定并送达员工；
  4. 办理档案和社会保险关系转移手续。

3. 若涉及贪污或职务侵占，可能构成刑事犯罪

• 法律风险：若员工通过伪造考勤记录、冒领工资等手段骗取单位财物，且数额较大（通常6万元以上），可能涉嫌《刑法》第二百七十一条规定的“职务侵占罪”或第三百八十二条规定的“贪污罪”（如员工具有国家工作人员身份）。
• 处理建议：单位应立即向公安机关报案，并配合调查。若刑事立案，员工不仅需退还工资，还可能面临刑事处罚（如有期徒刑、罚金）。

4. 单位未及时处理的法律后果

• 风险点：若单位长期放任旷工行为，可能被认定为对员工违规行为的默许，甚至影响后续追责的合法性。例如，员工可能主张单位已接受其旷工状态，从而拒绝返还工资。
• 应对建议：单位应定期核查考勤，对违规行为及时处理，避免“不作为”导致权利丧失。

总结建议

1. 立即核查事实：固定旷工证据（如考勤表、监控录像）；
2. 依据制度处理：按单位规章制度或劳动合同约定追回工资或解除合同；
3. 防范刑事风险：若发现员工存在骗取财物行为，及时报案；
4. 完善管理流程：避免因程序瑕疵导致处理无效。

如有具体案件细节（如旷工时长、单位制度内容等），可进一步向我咨询，我会结合实际情况提供更精准的法律意见。