结论：公司查出几年前货物数值有问题并怀疑有人做手脚但查不出具体证据时，是否报案需结合具体情况判断，但通常不建议仅凭怀疑直接报案，而应先通过内部调查、证据收集等手段尽可能固定相关事实。

一、从法律程序角度分析

1. 报案的法律依据与要求

   • 根据《刑事诉讼法》等相关规定，报案需提供一定的证据或线索，以证明存在犯罪事实或犯罪嫌疑。若公司仅凭怀疑而无任何实质性证据，公安机关可能不予立案或要求补充证据。
   • 报案时，应尽可能提供详细的线索，如涉事人员、时间、地点、货物数值异常的具体情况等，以便公安机关开展调查。

2. 报案后的法律后果

   • 若报案后公安机关经调查认为证据不足，可能不予立案，此时公司需承担报案未果的法律风险。
   • 若报案后经调查发现存在犯罪行为，但公司因证据不足而未能充分证明，可能影响后续的刑事追责和民事赔偿。

二、从公司内部管理角度分析

1. 内部调查的重要性

   • 在报案前，公司应先进行内部调查，尽可能收集相关证据，如货物出入库记录、财务报表、员工通讯记录等，以固定事实。
   • 内部调查还可以帮助公司了解货物数值异常的具体原因，是人为操作失误还是故意为之，从而为后续处理提供依据。

2. 内部处理的可能性

   • 若内部调查发现是员工操作失误导致货物数值异常，公司可以通过内部培训、制度完善等方式进行纠正，避免类似问题再次发生。
   • 若内部调查发现是员工故意为之，公司可以根据内部规章制度进行处罚，如警告、罚款、解雇等，并考虑是否追究其法律责任。

三、从实际操作角度分析

1. 证据收集的难度

   • 几年前货物数值异常的问题，可能因时间久远、证据灭失等原因而难以收集到充分证据。此时，公司应尽可能利用现有资源，如电子数据、证人证言等，进行证据固定。
   • 若证据确实难以收集，公司可以考虑聘请专业机构进行审计或调查，以获取更专业的意见和证据。

2. 报案前的准备

   • 在报案前，公司应准备好相关材料，如报案书、证据清单、涉事人员名单等，以便公安机关快速了解案情。
   • 公司还可以考虑与公安机关沟通，了解报案的具体要求和流程，以提高报案效率。

建议：公司可以先通过内部调查尽可能收集证据，若证据充分且确实存在犯罪嫌疑，再向公安机关报案。同时，公司也可以考虑咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。如果有进一步的法律问题，可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况给出更详细的解答。