结论前置：

1. 后邻不让留窗户一般无法律依据，但需考虑相邻权及具体规划情况。
2. 若窗户设计影响后邻权益，后邻可通过协商或法律途径解决。

详细分析：

在房屋买卖及后续的改建过程中，乙方作为新房主，在合法范围内享有对房屋的改建权。关于乙方盖二层后邻不让留窗户的问题，我们需要从多个角度进行分析。

一、相邻权角度

根据《民法典》中关于相邻权的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。这通常意味着，在改建房屋时，应尽量避免对相邻不动产的权利人造成妨碍或损失。然而，法律并未明确规定后邻有权阻止前邻在房屋上留窗户。窗户作为房屋的基本组成部分，其存在通常是为了通风、采光等基本生活需求。因此，除非窗户的设计或位置确实对后邻的权益造成了实质性影响（如侵犯隐私、影响采光等），否则后邻一般无权阻止。

二、具体规划与建筑规范角度

在改建房屋时，乙方需要遵守当地的建筑规划和规范。这包括房屋的高度、结构、安全等方面的要求。如果乙方在改建过程中违反了这些规定，那么后邻或相关部门有权提出异议并要求整改。但这与窗户本身的存在并无直接关系，而是与改建行为是否合规有关。

三、后邻的权益保护

如果乙方留的窗户确实对后邻的权益造成了影响（如窗户正对后邻的卧室或卫生间，侵犯了后邻的隐私），那么后邻有权与乙方进行协商，要求调整窗户的位置或采取其他措施以减少影响。如果协商无果，后邻还可以考虑通过法律途径解决争议，如提起相邻权纠纷诉讼。

四、建议与措施

1. 协商解决：首先，建议乙方与后邻进行友好协商，了解后邻的具体担忧和诉求，并尝试达成共识。
2. 调整设计：如果窗户的设计确实存在问题，乙方可以考虑调整窗户的位置、大小或采用其他设计方式以减少对后邻的影响。
3. 遵守法规：在改建过程中，乙方应严格遵守当地的建筑规划和规范，确保改建行为的合法性。
4. 法律途径：如果协商无果且后邻的行为确实侵犯了乙方的合法权益，乙方可以考虑通过法律途径解决争议。

总结与引导：

后邻不让留窗户一般无法律依据，但需考虑相邻权及具体规划情况。如果窗户设计确实影响后邻权益，后邻可通过协商或法律途径解决。在处理此类问题时，建议双方保持冷静和理性，通过友好协商或法律途径寻求妥善解决方案。如果您在房产领域遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。