结论：美容店以离职为由扣除学习费用，这一做法是否合法需视具体情况而定，但多数情况下可能缺乏法律依据。
一、合同与协议角度
存在明确约定：
- 若你入职时与美容店签订了劳动合同或培训协议，且协议中明确规定了离职时需要支付培训费用或违约金，同时这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么你可能需要按照协议约定执行。但即便如此，美容店扣除的费用也应当合理，且不能超过法定限额。
无明确约定或约定不合理：
- 若合同或协议中没有相关规定，或者规定不明确、不合理（如费用过高、未明确培训内容等），则美容店无权要求你支付这笔费用。此时，你可以拒绝支付，并有权要求美容店返还已扣除的费用。
二、培训性质角度
- 美容店提供的培训通常属于职业技能培训，旨在提升员工的专业能力。然而，并非所有培训都构成法律意义上的“专项培训”。特别是当培训是日常工作的一部分，且未产生额外成本（如师资、场地、设备等）时，要求员工支付培训费可能缺乏法律依据。
- 如果培训是店内常规业务操作的一部分，没有额外的投入，那么美容店以离职为由扣除学习费用，很可能是不合法的。
三、法律法规角度
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位不得随意扣除劳动者的工资或收取押金等费用。除非存在法定情形（如劳动者违反服务期约定或竞业限制约定），否则用人单位无权要求劳动者支付违约金或赔偿损失。
- 在你的情况下，如果美容店不能提供合法依据证明其扣除学习费用的合理性，那么这一做法很可能违反了法律法规。
四、应对建议
与美容店沟通：
- 尝试与美容店进行友好协商，解释自己的立场和依据。可以指出合同中无相关规定，或者培训并未产生额外成本等事实。
- 如果美容店坚持要求支付费用，你可以询问其具体依据和计算方式，以便更好地了解她的诉求。
收集证据：
- 保留好与美容店的聊天记录、通话录音等证据，以备不时之需。
- 如果可能的话，还可以收集其他同事的证言或店内相关文件，以证明培训的性质和费用情况。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在申请仲裁前，建议整理好相关证据，并了解自己的权益和可能的法律途径。
- 在仲裁过程中，要提供充分的证据证明自己的观点和诉求。
考虑后果：
- 在采取任何行动之前，都要仔细考虑可能的后果。如果你决定通过法律途径解决争议，可能会面临一定的时间和精力成本。
- 同时，也要做好与美容店关系破裂的准备，但请记住，维护自己的合法权益是至关重要的。
总结：美容店以离职为由扣除学习费用，这一做法是否合法需根据具体情况判断。在多数情况下，如果合同或协议中无明确规定，或者培训并未产生额外成本，那么美容店的做法可能缺乏法律依据。建议你与美容店进行友好协商，并收集好相关证据以备不时之需。如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。