民办非企业在与政府签订委托协议期间，是可以更换法人的，但需遵循一定的法律程序和条件。以下是对此问题的详细分析：
一、法人更换的法律依据
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，法人是具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务的组织。法人的变更，包括法人名称、住所、经营范围、法定代表人等事项的变更，均需依法进行登记。对于民办非企业单位而言，其法人的更换同样需要遵循相关法律法规的规定。
二、法人更换的具体程序
内部决策：民办非企业单位更换法人，首先需要经过其内部决策机构的决议，如董事会、理事会等。这一步骤是法人更换的前提和基础。
办理变更登记：在内部决策通过后，民办非企业单位需要向登记管理机关（如民政部门）申请办理法人变更登记。申请时，需要提交相关材料，如变更登记申请书、内部决策机构的决议、新任法定代表人的身份证明等。
公告与备案：完成变更登记后，民办非企业单位可能还需要按照相关规定进行公告，并将变更情况报相关部门备案。
三、与政府签订委托协议期间法人更换的注意事项
协议条款的审查：在更换法人前，民办非企业单位应仔细审查与政府签订的委托协议，看其中是否有关于法人更换的特别约定。如有，应严格按照协议条款执行。
与政府的沟通：法人更换可能影响到委托协议的履行，因此民办非企业单位在更换法人前，应与政府进行充分沟通，说明更换的原因、新任法定代表人的情况等，以确保委托协议的顺利履行。
确保协议的连续性：在更换法人后，民办非企业单位应确保与政府签订的委托协议能够继续有效履行。这可能需要新任法定代表人与政府重新确认协议条款，或签订补充协议等。
四、可能的法律后果
如果民办非企业单位在更换法人过程中违反相关法律法规或协议条款，可能会面临以下法律后果：
行政处罚：登记管理机关可能对民办非企业单位进行行政处罚，如警告、罚款、撤销登记等。
民事责任：如果因法人更换导致委托协议无法履行或给政府造成损失，民办非企业单位可能需要承担民事责任，如赔偿损失等。
建议：民办非企业在与政府签订委托协议期间更换法人时，务必遵循相关法律法规和协议条款的规定，确保法人更换的合法性和有效性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。