结论前置：在合同先签署扫描件、后提供纸质合同的情况下，扫描件中需明确标注关键注意事项，以保障双方权益并避免后续争议。以下是具体需写明的注意事项及法律依据：

1. 明确扫描件的效力及后续流程

• 标注内容：在扫描件首页或签名页注明“本扫描件为合同预签署文件，待双方确认无误后，将签署纸质正式合同，纸质合同签署后扫描件自动失效”或类似表述。
• 法律依据：根据《民法典》第469条，合同可采用书面、口头或其他形式，但涉及重大权益时，书面形式更易固定证据。扫描件虽具有法律效力，但需明确其与纸质合同的关系，避免被认定为最终合同。
• 目的：防止一方以扫描件为依据主张合同已成立，而另一方以未签署纸质合同为由否认效力。

2. 约定纸质合同签署的时间及方式

• 标注内容：在扫描件中增加条款，如“双方应于XX年XX月XX日前签署纸质合同，签署方式为当面签署或邮寄签署（需附回执）”。
• 法律依据：根据《民法典》第490条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或按指印时合同成立。明确时间可避免一方拖延签署导致合同未成立。
• 目的：固定双方履行义务的时间节点，减少因签署时间不明确引发的纠纷。

3. 限制扫描件的使用范围

• 标注内容：在扫描件中注明“本扫描件仅供双方内部审核使用，未经双方书面同意，不得对外披露或作为履行依据”。
• 法律依据：根据《民法典》第501条，当事人在订立合同过程中知悉的商业秘密或其他应当保密的信息，无论合同是否成立，不得泄露或不正当使用。
• 目的：防止扫描件被第三方获取后引发信息泄露或被恶意利用的风险。

4. 约定争议解决方式

• 标注内容：在扫描件中增加争议解决条款，如“因本合同产生的争议，双方应协商解决；协商不成的，提交XX仲裁委员会仲裁/向XX人民法院起诉”。
• 法律依据：根据《民法典》第577条，当事人可约定争议解决方式。明确仲裁或诉讼可避免后续因管辖权问题产生的争议。
• 目的：提前固定争议解决路径，降低诉讼成本。

5. 补充其他特殊约定

• 标注内容：根据合同类型（如买卖、租赁、服务），可补充特殊条款，如“扫描件签署后，若纸质合同内容与扫描件不一致，以纸质合同为准”或“扫描件签署后，任何一方不得单方修改合同内容”。
• 法律依据：根据《民法典》第143条，民事法律行为有效的条件包括意思表示真实。明确修改限制可防止一方擅自变更合同。
• 目的：针对具体合同类型，细化权利义务，减少履行中的不确定性。

操作建议：

1. 扫描件与纸质合同内容一致：确保扫描件与后续纸质合同条款完全相同，避免因内容差异引发纠纷。
2. 保留签署证据：通过邮件、短信或录音等方式记录双方对扫描件效力的确认过程。
3. 及时签署纸质合同：扫描件签署后，应尽快完成纸质合同签署，避免因时间拖延导致证据灭失。

如有具体合同类型或条款疑问，可直接向我咨询，我将结合实务经验提供详细解答。