法院确实可以不完全按照事故认定书认定同等责任进行判决，这有其明确的法律依据。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律依据
《最高人民法院、公安部关于处理交通事故案件有关问题的通知》第4条：
- 当事人仅就公安机关作出的道路交通事故责任认定和伤残评定不服，向人民法院提起行政诉讼或民事诉讼的，人民法院不予受理。但当事人对作出的行政处罚不服提起行政诉讼或就损害赔偿问题提起民事诉讼的，以及人民法院审理交通肇事刑事案件时，若经审查认为公安机关所作出的责任认定、伤残评定确属不妥，则不予采信，以人民法院审理认定的案件事实作为定案的依据。
《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第27条：
- 公安机关交通管理部门制作的交通事故认定书，人民法院应依法审查并确认其相应的证明力，但有相反证据推翻的除外。
二、司法实践中的裁判要点
证据不足：
- 如果交通事故认定书认定事实证据不足，法院可不采纳其责任认定。例如，若认定书中缺乏关键证据支持其责任划分，法院有权根据其他证据重新认定责任。
事实不清或适用法律错误：
- 若认定事实不清，适用法律错误，或划分责任不当，法院应予以纠正并重新确定事故责任。这要求法院在审理过程中，对认定书的内容进行全面审查，确保其符合法律规定和案件事实。
法院认为认定不妥：
- 法院认为认定书认定事实确属不妥的，可以法院认定的事实定案，而不必要求交通行政部门重新认定。这体现了法院在审理案件中的独立性和权威性。
三、实际操作中的建议
提供相反证据：
- 当事人一方或双方在民事诉讼中对《交通事故认定书》提出异议的，应当提供相反的证据或理由，并承担举证责任。这要求当事人在诉讼过程中，积极收集证据，支持自己的主张。
全面审查认定书：
- 法院在审理交通事故赔偿案件时，要根据证据规则判断是否采信《交通事故认定书》，认证重点是其真实性和合法性。因此，当事人在提交认定书时，应确保其内容真实、合法，并符合案件事实。
寻求专业帮助：
- 在处理交通事故赔偿案件时，由于涉及法律知识和诉讼程序，建议当事人寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助当事人更好地维护自己的合法权益。
总结来说，法院在审理交通事故赔偿案件时，有权根据证据规则和法律规定，对交通事故认定书进行全面审查，并决定是否采信其责任认定。若当事人对认定书有异议，应提供相反证据或理由，并承担举证责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。