关于学校是否会认出三方实习协议的章是真假的问题，这主要取决于学校对实习协议审核的严格程度以及章本身的真实性特征。

首先，学校在审核实习协议时，通常会关注协议的完整性、合规性以及印章的真实性。如果印章存在明显的伪造痕迹，比如印章的字体、大小、颜色与正规印章不符，或者印章的盖章位置、方式显得不专业，那么学校很可能会发现印章的问题。

其次，学校可能会通过与实习单位进行联系，核实实习协议的真实性。如果实习单位表示并未与该学生签订过实习协议，或者实习协议上的内容与实习单位提供的信息不符，那么学校也会对印章的真实性产生怀疑。

再者，随着技术的发展，一些学校或机构可能会采用更先进的技术手段来验证印章的真实性，比如通过扫描印章的二维码或查询印章的备案信息等。

因此，我建议你在签订三方实习协议时，一定要确保印章的真实性和合法性。不要试图伪造或使用非法的印章，因为这不仅可能违反法律法规，还可能对你的实习和学业造成严重的负面影响。

如果你对实习协议的印章真实性有疑问，或者不确定如何验证印章的真实性，你可以向学校的相关部门（如就业指导中心或实习管理办公室）咨询，他们通常会提供专业的指导和帮助。同时，你也可以要求实习单位提供印章的备案证明或其他相关证明文件，以进一步确认印章的真实性。