针对您提出的“因程序违法被法院撤销行政处罚没收的物品怎么办”这一问题，我将结合相关法律法规，为您详细解答。
首先，需要明确的是，当行政处罚因程序违法被法院撤销时，原本被没收的物品应当如何处理，这主要取决于物品的性质以及原行政处罚决定的具体情况。
一、物品性质与处理原则
属于被侵害人或善意第三人的合法财物：
- 根据《公安机关办理行政案件程序规定》第一百九十六条，这类财物应当及时返还给原主。因为行政处罚被撤销，意味着原处罚决定失去了法律效力，所以被没收的合法财物应当恢复原状，返还给合法所有者。
没有被侵害人的财物：
- 对于这类财物，如果它们不属于违禁品或无法变卖、拍卖的物品，通常会登记造册后上缴国库。这是为了确保公共财产的安全和合理利用。
违禁品、无价值或价值轻微的物品：
- 这类物品，如毒品、假币等违禁品，或者价值极低、无法变卖或拍卖的物品，会统一登记造册后予以销毁。这是为了防止这些物品再次流入社会，造成危害。
危险物品：
- 对于无法变卖或拍卖的危险物品，如易燃易爆物品、有毒有害物质等，会由县级以上公安机关主管部门组织销毁，或者交由有关厂家回收处理。这是为了确保公共安全。
二、具体处理流程
通知与认领：
- 对于应当退还原主的财物，原决定机关（如公安机关）会通知原主在六个月内来领取。如果原主不明确，会采取公告方式告知原主认领。
无主财物处理：
- 在通知原主或公告后六个月内，如果无人认领，这些财物会按无主财物处理，登记后上缴国库，或者依法变卖、拍卖后，将所得款项上缴国库。
特殊情况处理：
- 如果遇到特殊情况，如财物数量庞大、处理过程复杂等，可以酌情延期处理，但延长期限最长不超过三个月。
三、法律依据
- 您的疑问主要涉及《公安机关办理行政案件程序规定》的相关条款，特别是第一百九十六条和第一百九十七条，这些条款明确规定了被没收财物的处理方式和程序。
综上所述，当行政处罚因程序违法被法院撤销时，原本被没收的物品会根据其性质和原行政处罚决定的具体情况进行处理。如果是合法财物，应当及时返还给原主；如果是无主财物或违禁品等，则会按照相关规定上缴国库或进行销毁。希望这些解答能够帮助您更好地理解相关法律法规和处理流程。