如果代为保管的没收财物丢失，你可以要求公安机关进行赔偿。下面我将分情况详细分析这一问题：

一. 代为保管的财物丢失的责任归属

1. 公安机关责任：根据《公安机关办理行政案件程序规定》第一百八十七条，对于依法扣押、扣留、查封、抽样取证、追缴、收缴的财物以及由公安机关负责保管的先行登记保存的财物，公安机关应当妥善保管，不得使用、挪用、调换或者损毁。造成损失的，应当承担赔偿责任。因此，如果公安机关在代为保管期间丢失了财物，他们应当承担赔偿责任。

二. 申请赔偿的程序

1. 提出赔偿请求：你首先需要向负责保管财物的公安机关提出赔偿请求，说明财物丢失的情况，并提供相关证据，如财物清单、扣押决定书等。
2. 协商处理：公安机关在收到你的赔偿请求后，应当与你进行协商，确定赔偿金额和方式。
3. 诉讼途径：如果协商不成，你可以通过行政诉讼的方式，向人民法院提起诉讼，要求公安机关进行赔偿。

三. 注意事项

1. 及时提出赔偿请求：你应当在发现财物丢失后，及时向公安机关提出赔偿请求，以免错过赔偿的时效。
2. 保留证据：在提出赔偿请求时，你应当提供充分的证据，证明财物的价值以及公安机关的保管责任。

我建议，在申请赔偿过程中，你要保持冷静和理性，依法维护自己的权益。同时，也要注意保留好相关证据，以便在协商或诉讼中使用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。