此案并未超过行政处罚的追诉时效。针对您提出的“司法机关侦办两年的案件移送工商行政处罚时效是否过了”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

1. 行政处罚追诉时效的一般规定：

   • 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条：“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。”
   • 在本案例中，若仅从违法行为发生时间（2015年1月1日至2017年4月12日）与公安机关发现时间（2021年7月22日）来看，似乎已超过两年的追诉期。但关键在于，该案涉及公民生命健康安全，且存在危害后果，因此追诉期限应延长至五年。

2. 刑事案件与行政处罚追诉时效的衔接：

   • 当案件由司法机关侦办并移送行政机关进行行政处罚时，应考虑刑事案件追诉时效对行政处罚追诉时效的影响。
   • 根据《中华人民共和国刑法》第八十七条关于犯罪追诉时效的规定，非法经营药品罪的法定最高刑未设上限，理论上最长追诉期为20年。虽然本案最终未以非法经营药品罪定罪，但此规定说明了对于严重违法行为的追诉期限可以很长。
   • 在实际操作中，若司法机关在追诉时效内发现了违法行为，并启动了调查、取证和立案程序，即使后续案件性质发生变化（如从刑事案件转为行政案件），也不应简单以超过行政处罚追诉时效为由不予处罚。

3. 具体案例分析：

   • 在您提供的参考案例中，李某因涉嫌非法经营药品罪被公安机关逮捕并提起公诉，后因刑事法律政策发生变化被撤诉并建议移送药品监管部门处理。
   • 药品监管部门在接到案件后，对于追诉时效问题产生了分歧。但根据律师见解，此案并未超过追诉时效，因为任何一个机关对类似违法违纪行为只要启动调查、取证和立案程序，均可视为被发现。

4. 法律建议：

   • 对于司法机关侦办的案件，在移送行政机关进行行政处罚时，应充分考虑刑事案件追诉时效对行政处罚追诉时效的影响。
   • 行政机关在接收移送案件时，应仔细审查案件材料，确认违法行为是否在追诉时效内被发现，并依法作出行政处罚决定。
   • 若存在争议，建议及时咨询专业律师或法律机构，以确保行政处罚的合法性和有效性。

综上所述，此案并未超过行政处罚的追诉时效。行政机关在接收移送案件时，应依法进行审查并作出相应的行政处罚决定。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。