被告不可以无正当理由不配合笔迹鉴定。以下从不同角度为您详细分析：
一、被告配合笔迹鉴定的法律义务
在合同纠纷等民事诉讼中，笔迹鉴定往往作为关键证据来认定相关事实。根据相关法律规定及司法实践，被告有配合进行笔迹鉴定的义务。这是因为笔迹鉴定结果对于案件事实的查明和公正裁判具有重要意义。若被告无正当理由拒绝配合，可能构成对司法程序的不当干扰，影响案件的正常审理。
二、被告不配合的法律后果
法院释明与督促：面对被告不配合的情况，法院首先会向被告释明不配合的法律后果，敦促其配合进行笔迹鉴定。这是法院在维护司法程序公正和效率方面的职责所在。
承担不利后果：若被告经法院释明后仍拒绝配合，且无正当理由，法院可以根据现有证据进行综合判断。在缺乏直接相反证据的情况下，法院可能会推定原告关于笔迹的主张成立，从而对被告作出不利的事实认定。这是因为被告的不配合行为导致无法通过笔迹鉴定这一直接证据来查明事实，被告应承担相应的法律后果。
强制措施的可能性：在极端情况下，若笔迹鉴定对于案件事实的查明具有决定性作用，且被告无正当理由拒不配合，法院可能会考虑采取强制措施，如罚款、拘留等，以促使被告履行配合义务。但这一措施的实施需严格遵循法律程序，确保被告的合法权益不受侵害。
三、原告的应对策略
申请法院介入：若被告不配合笔迹鉴定，原告可以向法院申请，要求法院介入处理。法院会根据具体情况采取相应措施，如向被告释明法律后果、敦促其配合，或根据现有证据进行综合判断。
寻找替代证据：在等待法院处理的过程中，原告可以积极寻找其他能够证明案件事实的证据，如复印件、照片、扫描件或间接证据（如证人证言、电子邮件等）。这些证据可以在一定程度上弥补笔迹鉴定缺失带来的影响。
重新提出鉴定申请：若原鉴定申请因被告不配合而未能进行，原告可以在符合条件的情况下重新提出鉴定申请。在重新申请时，原告应确保提供充分的证据和理由，以说服法院同意进行笔迹鉴定。
四、特殊情况下的处理
复印件作为鉴定材料：虽然原件是笔迹鉴定的最佳材料，但在某些特殊情况下，如原件已丢失或无法获取时，复印件也可以作为鉴定材料。但需要注意的是，复印件的鉴定结果可能受到一定影响，其证明力可能相对较弱。因此，在使用复印件进行鉴定时，应尽可能提供其他辅助证据来增强其证明力。
鉴定人员到庭质证：若被告对笔迹鉴定结果有异议且拒绝配合重新鉴定，原告可以要求鉴定人员到庭进行质证。通过对鉴定人员的质证，可以确定鉴定是否合法、鉴定意见是否正确，从而达到推翻或确认鉴定意见的目的。
建议：在面对被告不配合笔迹鉴定的情况时，原告应保持冷静和理性，积极采取法律手段来维护自己的合法权益。同时，也可以考虑与被告进行沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。