车辆出具遗产证明后，绿本（机动车登记证书）不一定会被司法部门扣留，这取决于具体的情况和司法程序的需求。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 遗产证明与车辆所有权转移

• 当车辆作为遗产进行继承时，首先需要办理的是遗产继承手续，这通常包括出具遗产证明、办理继承公证等步骤。
• 在这些手续完成后，车辆的所有权会从原车主转移到继承人名下。此时，继承人需要办理车辆过户手续，而机动车登记证书（绿本）是过户过程中必不可少的文件。

2. 司法部门扣留绿本的情况

• 诉讼或执行程序：如果车辆涉及诉讼或执行程序，如遗产纠纷诉讼、债务执行等，司法部门可能会根据案件需要扣留绿本，以确保车辆不被非法转移或处置。
• 证据保全：在某些情况下，为了保全证据或防止证据灭失，司法部门也可能会扣留绿本作为案件证据的一部分。
• 协助调查：如果车辆与某起案件有关联，且绿本上的信息对调查至关重要，司法部门可能会要求扣留绿本以协助调查。

3. 不扣留绿本的情况

• 正常继承过户：如果车辆继承过程顺利，没有涉及任何诉讼或执行程序，且继承人能够提供完整的继承手续和证明文件，那么司法部门通常不会扣留绿本。
• 自愿交出：在某些情况下，即使车辆涉及诉讼或执行程序，如果继承人自愿交出绿本以配合司法程序，那么司法部门也不会强制扣留。

4. 法律建议

• 保留相关证据：无论绿本是否被扣留，继承人都应保留好与车辆继承相关的所有证据和文件，以备不时之需。
• 咨询专业律师：如果车辆继承过程涉及复杂的法律问题或诉讼程序，建议继承人咨询专业律师以获取法律帮助和指导。
• 配合司法程序：如果绿本被司法部门扣留，继承人应积极配合司法程序，提供必要的协助和信息，以加快案件的处理进度。