核心结论：遇到抵押公司跑路、绿本（机动车登记证书）下落不明的情况，您需要分步骤采取法律措施保护自身权益，具体可从以下角度处理：

1. 立即向公安机关报案，固定证据

抵押公司跑路可能涉及刑事犯罪（如合同诈骗、非法吸收公众存款等），您需第一时间携带以下材料到当地公安机关经侦部门报案：

• 抵押合同、借款协议原件；
• 转账记录、收据等资金往来凭证；
• 抵押公司营业执照复印件（如有）；
• 沟通记录（微信、短信、邮件等）；
• 其他能证明抵押关系的证据（如抵押登记证明、车辆评估报告等）。

作用：通过刑事立案追查公司实际控制人，若案件定性为刑事犯罪，后续可通过追赃程序挽回损失；同时，公安机关的调查结果可作为民事诉讼的重要证据。

2. 查询车辆抵押登记状态，确认权利归属

携带身份证、行驶证到当地车管所查询车辆抵押登记信息，重点确认：

• 抵押是否已解除（若公司未办理解押，车辆仍处于抵押状态）；
• 抵押权人是否为跑路公司（避免被其他债权人主张权利）；
• 是否存在重复抵押或虚假登记情况。

若抵押未解除：您需通过法律程序要求解除抵押（见下文民事诉讼部分）；
若抵押已解除但绿本未归还：可凭车管所出具的解押证明，向公安机关申请补办绿本（需提供报案回执、身份证明等材料）。

3. 通过民事诉讼主张权利

若公安机关未立案或刑事追赃无果，您需向法院提起民事诉讼，分两种情况处理：

情况一：抵押合同有效，公司违约

• 诉求：要求解除抵押合同、返还绿本、赔偿损失（如利息、违约金等）；
• 证据：除报案材料外，需补充证明公司未履行合同义务的证据（如未按约定放款、未办理解押等）；
• 注意：若公司已无财产，即使胜诉也可能面临执行困难，需提前申请财产保全（如冻结公司账户、查封车辆等）。

情况二：抵押合同无效（如公司无资质、虚构事实）

• 诉求：确认合同无效，要求返还车辆、绿本及赔偿损失；
• 依据：根据《民法典》第154条，若公司以欺诈手段订立合同，您可主张撤销合同；
• 风险：需证明公司存在主观恶意（如虚构抵押资质、伪造文件等），证据要求较高。

4. 防范后续风险，及时补办绿本

无论刑事或民事程序结果如何，您均需尽快补办绿本，避免车辆被他人冒名抵押或转让：

• 流程：向车管所提交《机动车牌证申请表》、身份证明、报案回执、车辆照片等材料；
• 费用：工本费约10-15元（具体以当地车管所为准）；
• 时效：一般1-3个工作日可领取新证。

5. 特殊情形：车辆被转让或二次抵押

若发现车辆已被公司擅自转让或再次抵押，您需立即采取以下措施：

• 向公安机关报案：追究公司及相关人员刑事责任（如盗窃罪、诈骗罪）；
• 向法院提起物权确认之诉：主张您对车辆的所有权，要求撤销非法转让或抵押登记；
• 申请财产保全：防止车辆被进一步处置。

温馨提示：抵押公司跑路案件往往涉及复杂法律关系，建议优先通过刑事程序追查公司资产，同时同步启动民事诉讼和绿本补办流程。若您对具体操作（如证据收集、诉讼策略）有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的材料提供详细指导。