员工吃回扣达到3万元以上就可能构成犯罪，但具体立案标准还需根据员工身份和回扣性质来判定。以下是详细分析：

一、非国家工作人员受贿罪

如果员工是非国家工作人员（如私营企业员工），利用职务上的便利，索取或非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额在3万元以上的，就达到了非国家工作人员受贿罪的立案标准。这意味着，一旦回扣数额达到或超过3万元，司法机关就有可能依法追究其刑事责任。

• 法律依据：根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(二)》的相关规定，公司、企业或者其他单位的工作人员利用职务上的便利，索取他人财物或者非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额在三万元以上的，应予立案追诉。

二、受贿罪

如果员工是国家工作人员（如国有企业员工、政府机关工作人员等），利用职务上的便利，索取或非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额在3万元以上的，就可能构成受贿罪。受贿罪的立案标准与非国家工作人员受贿罪在数额上相同，但主体身份和法律后果有所不同。

• 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，国家工作人员利用职务上的便利，索取他人财物，或者非法收受他人财物，为他人谋取利益的，属于受贿。受贿数额在三万元以上不满二十万元的，应当认定为“数额较大”，依法追究刑事责任。

三、单位受贿罪

如果员工所在单位（如国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体）索取、非法收受他人财物，为他人谋取利益，且情节严重，数额在10万元以上的，就可能构成单位受贿罪。这种情况下，立案标准针对的是单位整体行为，而非单个员工。

• 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体，索取、非法收受他人财物，为他人谋取利益，情节严重的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处五年以下有期徒刑或者拘役。立案标准为单位受贿数额在十万元以上，或者虽不满十万元，但具有其他严重情节。

四、其他注意事项

1. 回扣性质：回扣是否构成犯罪，还需看其是否违反了国家规定或公司内部规定。如果回扣是合法的商业折扣或返利，且符合相关规定，则不构成犯罪。
2. 证据收集：一旦发现员工存在吃回扣的嫌疑，公司应及时收集证据，如合同、协议、聊天记录、转账记录等，以便在后续处理中维护自身权益。
3. 法律后果：构成犯罪的员工将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。同时，公司也可能因此遭受经济损失和声誉损害。

建议：作为员工，应严格遵守法律法规和公司内部规定，拒绝任何形式的回扣行为。作为公司，应建立健全内部管理制度，加强对员工的监督和教育，防止类似事件的发生。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。