以公司名义签订协议并开具发票，通常算作职务行为，但具体还需结合实际情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、职务行为的定义与判断标准
职务行为，一般指的是员工在其工作职责范围内，为了公司的利益而进行的行为。判断一个行为是否属于职务行为，通常需要考虑以下几个因素：
- 行为主体：行为是否由公司员工实施。
- 行为目的：行为是否为了公司的利益。
- 行为范围：行为是否在员工的工作职责范围内。
- 授权情况：员工是否得到了公司的明确授权。
二、以公司名义签订协议并开具发票的行为分析
行为主体：
- 如果签订协议和开具发票的行为是由公司员工（如法务、财务或业务人员）实施的，那么从行为主体上看，符合职务行为的特征。
行为目的：
- 签订协议和开具发票通常是为了公司的业务往来和财务管理，显然是为了公司的利益。
行为范围：
- 签订协议和开具发票往往是公司员工（特别是法务、财务或业务人员）的常规工作职责之一。因此，从行为范围上看，也符合职务行为的特征。
授权情况：
- 在大多数情况下，公司员工在签订协议和开具发票时，会得到公司的明确授权或按照公司的常规流程进行。即使没有明确的书面授权，如果行为符合公司的常规业务操作和利益，也可能被视为职务行为。
三、特殊情况下的判断
尽管以公司名义签订协议并开具发票在大多数情况下属于职务行为，但也存在一些特殊情况需要特别注意：
员工超出职责范围：
- 如果员工签订协议或开具发票的行为超出了其工作职责范围，且没有得到公司的明确授权，那么该行为可能不被视为职务行为。
个人行为与公司行为混同：
- 在某些情况下，员工可能以个人名义与公司进行交易，或者将个人行为与公司行为混同。这种情况下，需要仔细区分个人行为与公司行为，以判断是否属于职务行为。
公司规章制度与授权流程：
- 不同公司可能有不同的规章制度和授权流程。因此，在判断一个行为是否属于职务行为时，还需要考虑公司的具体规定和流程。
四、法律建议
明确职责与授权：
- 公司应明确员工的工作职责和授权范围，以避免因职责不清或授权不明而产生的法律纠纷。
完善内部流程：
- 公司应建立完善的内部流程，包括协议签订和发票开具的审批、备案等流程，以确保行为的合法性和合规性。
及时咨询与应对：
- 如果公司或员工在签订协议和开具发票过程中遇到法律问题或纠纷，应及时咨询专业律师并采取相应的应对措施。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。